孢子是植物產生的壹種生殖細胞或休眠細胞，可以直接發育成新的個體。孢子通常很小，是單細胞的。由於其不同的性質、發生過程和結構而有不同的名稱。植物通過無性繁殖產生的孢子稱為“無性孢子”，如分生孢子、孢子囊孢子、遊動孢子等。有性生殖產生的孢子稱為“有性孢子”，如接合孢子、卵孢子、子囊孢子、擔孢子等。營養細胞通過細胞壁加厚和積累營養物質直接抵抗不良環境條件的孢子稱為“厚垣孢子”和“休眠孢子”。當孢子存在性別差異時，雌雄同體孢子可分為同型和異型。前者大小相同；後者大小不同，分別稱為大孢子和小孢子，分別發育成雌、雄配子體，在高等植物中較為常見。
在光學顯微鏡下，孢子有圓形、橢圓形、桿狀、圓柱形、瓜子形、紡錘形和半月形，孢子的顏色非常豐富。孢子表面的紋飾因種而異，在電子顯微鏡下可以清楚地看到。有的光滑，有的折疊，有疣，有刺，有毛或有鱗，刺分粗細，大小，長短，密度。