紫外熒光墨水的關鍵原理是在墨水中加入具有紫外激發的可見熒光(絡合物)。通過吸收的光能，產生原子的能級躍遷，然後釋放吸收的多余能量。防偽特征是在紫外光(200nm~400nm)照射下發出紅、黃、綠、藍(400nm~800nm)可見光。這種墨水可分為有色和無色，包括長波(365納米)和短波(254納米)。熒光顏料是壹種有機絡合物，經研磨精制而成，發光率高，通常為無色或淡白色。在紫外光(200 nm ~ 400 nm)的照射下，呈現出各種顏色的可見光(400 nm ~ 800 nm)。按激發光源波長可分為短波紫外激發熒光顏料(激發波長為254nm)和長波紫外激發顏料(激發波長為365nm)。
熒光筆有熒光劑，遇到紫外線(日光、日光燈、汞燈較多)會產生熒光效果，發出白光，從而使顏色看起來有耀眼的熒光。
現在也有可以隱藏的無色熒光筆。寫完就沒有顏色了。被筆後的紫光照亮後，就可以顯示書寫的內容了。
二、熒光筆的危害
熒光筆的原理是通過吸收光能產生原子的能級躍遷，然後釋放吸收的多余能量。熒光筆裏加了壹些熒光劑。有些熒光物質有毒，有潛在致癌成分，長期使用對人體有害，而且價格便宜。壹些小作坊為了降低成本，會使用有毒的熒光劑作為熒光筆的原料。此外，由於熒光筆中含有大量熒光劑，長期使用也會嚴重影響孩子的視力。
三、如何選購熒光筆
1、熒光筆的選擇首先要註意材質的外觀，硬塑料的表面要光滑平整，沒有毛刺、氣泡、凹凸不平的外觀缺陷，筆的粗細適中，不要太粗也不要太密實。
2.尖端厚度的選擇。如果是作為突出文字的熒光筆，筆尖要粗平，有利於壹次性塗抹全部文字。如果是給孩子塗鴉畫畫用的，那麽就要選擇壹套顏色比較多的筆。
3.熒光筆的書寫效果要明亮，文字要透明，不會影響文字的顯示效果。水適中，紙不透明。
4.挑選時，可以將兩張半透明的報告紙或打印紙疊在壹起，用熒光筆在上面的紙上寫幾個字。註意受挫程度，然後翻過來檢查。質量好的熒光筆，上層紙背面應該沒有顏色滲透，下層紙應該沒有字跡。
5.因為長期使用熒光劑會影響視力，甚至累積的有害物質會致癌，所以購買時要特別謹慎，盡量購買符合國家標準的正規產品。