古今姓氏書辯證以《四庫全書》本《辯證》為底本；四庫本原附館臣註於行間，數量較多，今改為頁下註全部保留，即校勘記之“四庫本原註曰”部分。本編以錢熙祚《守山閣業書》本《辯證》為參校本，即校勘記所稱“錢氏校本”者。錢氏校勘記中之有債值部分，予以充分吸收，不收敢攘善，特註明“錢氏曰”字樣。凡整理者所加按語，壹律冠以“今按”二字。原文中的明顯錯誤（如已己已等）由予徑改，不出校記．點校者在對原文施加新式標點的同時，適當分段，以清眉目。《辯證》壹書及四庫本原註、《守山閣業書》本所附錢熙祚按語，封古籍大多采用縮略或約定俗成的名稱，如稱《左傅》為《傅》，《魏書·官氏誌》為《魏誌》，《新唐書·宰相世系表》為《唐世系表》等。錢熙祚校勘記中徵引了部分殘宋本原文，本編分別補入各卷，特加陰影處理，以示區別。為方便讀者檢索，本編制作了姓氏筆劃索引附於書後。