《錢鐘書傳》，上海文藝出版社，1993；臺灣業強出版社1993；修訂本，復旦大學出版社，2010。
《管錐編讀解》，上海古籍出版社，2000；增訂本，2005。
《漁人之路和問津者之路》，復旦大學出版社，2006。
《古典學術講要》，上海古籍出版社，2010。
《<莊子>內七篇析義》，上海人民出版社，2012。
《潘雨廷先生談話錄》（記述），復旦大學出版社，2012。
整理：
壹、《周易表解》，上海社會科學院出版社，1993；臺北建安出版社，1997；增訂本，上海社會科學院出版社，2004。
二、《易與佛教·易與老莊》，遼寧教育出版社，1998；增訂本，上海古籍出版社，2005。
三、《易學史發微》，復旦大學出版社，2001。
四、《易老與養生》，復旦大學出版社，2001。
五、《讀易提要》，上海古籍出版社，2003（精裝）；2006（平裝）。
六、《道教史發微》，上海社會科學院出版社，2003；增訂本，復旦大學出版社，2012。
七、《道藏書目提要》，上海古籍出版社，2003。
八、《易學三種》（《過半刃言·黼爻·衍變通論》），上海古籍出版社，2005。
九、《易學史叢論》，上海古籍出版社，2007。
十、《周易虞氏易象釋·易則》，上海古籍出版社，2009。
十壹、《道教史叢論》，復旦大學出版社，2012。
編集：
《潘雨廷學術文集》，上海人民出版社，2011。
校點：
《學易筆談、讀易雜識》，遼寧教育出版社，1997。