張元素總結的臟腑辨證主要見於他的醫學著作《臟腑標本寒熱虛實用藥式》和《珍珠囊》中。
張元素他首先提出肝臟的正常生理功能：“肝與膽為表裏，足厥陰少陽也物之始生也。其氣軟而弱，其脈弦長曰平。”他認為肝臟的功能性質主要表現為“以風治肝”和“以震肝膽”，其病機有寒熱虛實之分。
對於肝臟的病理變化，他詳細描述了六種不同情況，如脈急主惡言，微急主氣在胸脅下，緩主嘔逆，微緩主水痹，大主內癰、吐血，緩大主筋痹。這些描述旨在說明肝臟在不同病機情況下的變化，並據此提出相應的藥物和處方。
張元指春素他還主張先從辨臟腑的虛實、寒熱著手，將臟腑辨證的理論運用到臨床實踐中。他的臟腑辨證理論既體現了中醫傳統的辨證思想，又具有自己的獨特見解，對後世中醫臨床治療提供了有益的參考。
張元素對醫學的重大貢獻：
1、系統闡述臟腑生理功能：張元素總結了以臟腑寒熱虛實以言病機的學說，將臟腑的生理、病理、辨證和治療各成系統，較前又有提高，使臟腑辨證說由此而漸被眾多醫家所重視，臟腑病機理論也被不少醫家所研究。
2、提出獨特的藥物理論：張元素在《內經》的理論基礎上，強調藥物的四氣五味之厚薄，是影響藥物作用的重要方面。正由於藥物唯渣耐有四氣五味厚薄的不同，因此藥物作用才會出現升降浮沈的區別。因此，對於每壹藥物功用的解釋，他強調首先應明確其氣味厚薄，然後再進壹步闡梁哪發其功效。
3、對藥物學理論的推動：張氏對藥物學研究頗有發揮，尤其在藥物學的理論認識和臨床臟腑用藥方面，更為突出。他強調藥物的四氣五味之厚薄影響藥物的作用，並據此提出相應的治療方法和藥物處方。