林章從小聰明，七歲就能成詩。嘉靖四十二年(1563)，侵華日軍入侵福建沿海，13歲的林章上書朝廷，為皇軍入侵求情。萬歷元年(1573)，林章鄉試獲勝，屢試不爽。後來投奔齊家軍，任軍事參謀。在壹次聚會上，他即興為《鸞陽宴》作序。三巡酒前，詩序融合，博得戚繼光和在場賓客的稱贊。戚繼光得知林章是個文才，便向他進貢。林章馬上分發給窮人。後來，林章成了戚繼光的幕僚。不久，林章家遷到金陵(今南京)。當時的南京法曹劉貪帳枉法，審判不公。林章義憤填膺，為民喊冤。因為他身體虛弱，他受到迫害，被監禁了三年。獲釋後於10進入燕京。明政府與日本不和，發生了白關戰爭。投降派主張和談。林章聞訊後，兩次上書反駁和談，要求明政府出海，以奇兵消滅敵人，但明政府不予理會。
此後，林章上書皇帝，要求停止礦稅，並陳述了軍制和鹽務。萬歷皇帝看了信很感動，交給內閣處理。大權在握的大臣沈對萬歷皇帝的聖旨置若罔聞，把林章送進了監獄。林章寫了兩部傳奇小說《清秋記》和《關》後，在獄中突發疾病去世。林章關心國家和人民的精神深受人民的喜愛。很快，日軍入侵，礦工暴動，林張之前說的都好了。董其昌為了永垂不朽，把林章的朗誦編進了清史。林谷渡(1580-1666)在《文先生傳》壹文開篇記載:“...這壹建議是龔永慶提出來的，宗齊昌在其國史中被忽略了。故憲大臣沈工少方以史聞名，少司馬鄒公威廉有吊法，檢察員鐘公有詩拜墓。無非是可憐其才，悲哀其窮……”可見林章是壹個知名度很高的人。