敦化正覺寺始建於清朝光緒年間，最初規模不大，幾經擴建整修，到民國年間臻於完善。當年院落，東西20米，南北40米。有正殿三楹，磚瓦結構，東西長12米，南北寬6米，建築面積72平方米，硬山式結構，方向南，檐角墻頭有雕磚花紋裝飾。殿內原有泥塑佛像，已遭人為破壞，解放後留有大殿殘骸，後不復存在。遺址坐落在現敦化四中院後部。正覺寺因壹向為比丘尼（俗稱尼姑）居住，人們慣稱其為娘娘廟。正覺寺在過去年代裏是敦化城內的主要廟宇之壹，每年農歷四月十八日和二十八日都舉行廟會，遠近鄉民紛紛前來趕會，十分熱鬧。
正覺寺對於敦化地方佛教的傳播曾超過很大作用，培育了壹些根性很深的佛門高徒，現居美國紐約正覺寺的釋佛性法師就是在敦化正覺寺落發為尼的。 釋佛性，俗名關淑琴，滿族正白旗，1925年生於吉林省敦化市官地鎮崗子村。從小就萌生菩提之心，發願出家修行。19歲開始吃長齋，21歲在原正覺寺皈依佛門，削發為尼，拜興運法師為師。在皈依佛門之後的60多年時光中，為求證佛法，她雲遊各處道場，從北疆到南域、從國內到國外、從東方到西方，經歷了常人難以想象的“苦行遊僧”的千辛萬苦。
建於清朝晚期的正覺寺，在歷史上的發展沒有正覺寺這樣的規模。但是在香火的鼎盛時期，還有許多根性深厚的高僧擔任寺院的住持，歷任住持先後有唯空法師、尊果法師、興運法師。原正覺寺最後壹任住持興運法師，親眼目睹了正覺寺的衰落，內心的痛苦可想而知。在眾僧侶相繼離開的那些日子裏，她始終壹心向佛，堅守在寺院破舊的房子裏。因此振興正覺寺壹直是興運法師永不破滅的願望。
1980年，美籍華人、美國紐約正覺寺住持釋佛性大師應中國佛教協會會長趙樸初邀請回國朝聖南方四大佛教名山，並回故裏吉林省敦化市省親。借此機會才得以回故鄉探望師父。當興運法師得知自己的弟子佛性法師在美國已建立“圓通寺”，就諄諄囑咐佛性法師壹定要復興重建正覺寺！於是不久“圓通寺”就更名為“正覺寺下院”。由此開始，佛性法師醞釀形成回國重建正覺寺的宏願。興運住持於1983年圓寂，未能目睹重建振興的正覺寺，聆聽鐘鼓重鳴。但是相信她在西方極樂世界壹定會感同身受的。旅途中他向趙樸和政府主管部門鄭重提出要回家鄉重建正覺寺的請求。
這以後，大師又多次向政府提出重建正覺寺壹事。自1979年趙樸妝訪美後，大師結識趙樸老，相互間通過多封書信、多次通話及多次會話，友誼日深。1994年敦化正覺寺大雄寶殿開光前，大師和敦化政界要人去北京專程拜訪趙樸老。佛性請趙樸老夫人說：“他身體不好寫不了。”趙樸老只是輕輕壹笑，也沒說什麽，待佛性大師回敦化後第三天，就收到趙樸老寄來的條幅。佛性很欽佩趙樸老的為人，發也說趙樸老對她回家鄉建寺給予非常大的支持。趙樸老曾和佛性說過，妳們東北佛教發展最落後。經過佛性大師的艱辛努力和主管部門的籌劃協助，1992年，敦化市政府正式發函邀請佛性大師來敦化，佛性受到誠摯的接待，簽署了重建正覺寺上院備忘錄。同年9月正覺寺在敦化六頂山破土動工。
1994年9月10日敦化正覺寺大雄寶殿開光。中國佛教協會會長趙樸初為正覺寺題寫了“正覺寺”和“大雄寶殿”匾額，為大雄寶殿抱柱題聯：“正道示周行遍十方樹金繩戒香梵缽，覺王開凈土試四望松風水月仙露明珠。”美國萬佛城宣化上人捐助了數以萬計的美金。國國佛教協會副會長、《法音》佛教期刊主編、河北柏林寺住持 凈慧法師積極贊助。著名學者、作家、北京大學教授季羨林先生對總體設計方案在宗教文化方面進行了全面論證和肯定。在佛教建築方面，中國佛教協會妙華法師親臨現場指導。古籍研究專家羅繼祖教授，著名書法家段成桂、叢文峻，著名作家張笑天等都為廟宇題寫了楹聯。正覺寺也得到了海內外佛教信徒的大力。1995年10月，壹期廟宇群土建工程基本如期完成。
多年來，釋佛性大師心不退轉，念不退轉，道不退轉。在正覺的道路上堅韌不拔，發般若宏願，發慈悲大願，護國護教，在紐約發展和弘揚東方文化，建設規範佛教道場，成為第壹個到美加地區弘揚中國佛教文化的女法師，在美國建成了第壹個也是最大的女眾道場—正覺寺下院。此後，為實現師父的遺願，又經歷了二十多年的艱苦奮鬥，以愛國、愛教、愛家鄉的慈善本懷，回家鄉敦化建起了世界第壹大的尼眾道場—正覺寺上院。上下兩院成為發展東西方佛教文化的橋梁，佛性法師也成為享譽國內外的著名大法師。