海南師範大學圖書館現設六個部門，即辦公室、采編部、流通閱覽部、期刊部、技術與電子資源服務部、信息咨詢與特藏部。
辦公室 位於圖書館北座壹樓，在館長領導下處理全館行政、後勤日常事務。具體負責全館的文書、檔案、人事、財務、總務、基建、維修以及各項統計工作。管理館內衛生、考勤、電話、勞動、基金及家具、設備並供應各類日常工作用品。負責上傳下達、內外聯系、接待來訪、以及辦理個人借閱證等工作；
采編部 位於圖書館南座壹樓，有二個主要任務：
壹是文獻采訪。根據該校學科建設、教學和科研需要，搜集采訪中外文圖書、電子資源等文獻資料，補充館藏，建設具有本館特色的文獻資源體系。
二是文獻整序。按國際國內通行標準對入藏的各種載體文獻進行加工整理，通過分類主題標引、著錄、加工等系列工作，使館藏文獻有序化；負責本館書、電子資源等文獻書目數據庫的建設和維護；制定本館各類文獻資料分類、著錄、主題標引和機讀目錄使用標準的細則以及新書報導工作。參加海南省高校各類文獻聯合目錄的建設工作。
流通閱覽部 位於圖書館北座三樓，分管：中文圖書第壹借閱室、中文圖書第二借閱室、中文圖書第三借閱室、館際互借服務和證卡管理。本部的主要任務是提供1950年以後入藏的中文圖書的外借和閱覽服務，提供圖書的續借和預約服務。負責館際互借服務，本部還負責辦理個人借閱證及個人借閱證的掛失、退證工作。
中文圖書第壹借閱室：位於圖書館北座三樓，主要收藏2000年以後入藏的社會科學類圖書。
中文圖書第二借閱室：位於圖書館北座四樓，主要收藏2000年以後入藏的自然科學類中文圖書；
中文圖書第三借閱室：位於圖書館南座三樓，主要收藏1986-1999年入藏的各類中文圖書。
中文圖書第四借閱室：位於圖書館北座壹樓，主要收藏1985年前(含1985年)出版入藏的各類中文圖書 和部分贈送圖書。
館際互借服務：位於圖書館北座三樓，負責辦理海南省高校館際互際服務的有關事務。
期刊部 位於圖書館北座九樓，分管五個庫室：現刊閱覽室、現報閱覽室、中文過刊閱覽室、報紙合訂本閱覽室、裝訂室。本部的主任務是根據該校教學和科研需要，搜集采訪中外文報紙、期刊，並進行分類編目，提供閱覽服務。
現刊閱覽室：位於圖書館北座九樓西，收藏當年訂購中外文期刊。
現報閱覽室：位於圖書館北座九樓東，收藏當年訂購的中外文報紙。
中文過刊閱覽室：位於圖書館南座二樓，收藏歷年的中文期刊合訂本。
中文報紙合訂本閱覽室：位於圖書館北座壹樓東，收藏歷年的中、外文報紙合訂本。
裝訂室：位於圖書館南座二樓，主要任務是負責圖書館報刊裝訂、破損合訂本報刊重新裝訂。
技術與電子資源服務部 位於圖書館北座六樓，分管三個庫室：第壹電子閱覽室、第二電子閱覽室、投影室。本部的主要任務是負責圖書館ILASⅡ系統、設備的維護管理、網絡管理和數據庫管理；負責電子閱覽室工作；提供電子資源閱覽服務和投影播放等服務。
第壹、二電子閱覽室：位於圖書館北座五、六樓，有讀者用機430臺，可提供目錄查詢，電子圖書、電子期刊、專業數據庫、音像資料等電子資源的利用；提供Internet瀏覽等服務。
投影室：位於圖書館北座六樓，收藏壹定數量的影像制品，內容涉及思想政治、國防、科技、文化教育等方面。其中有不少外文教學片和經典文學名著等影像精品。本室是圖書館進行讀者教育與資源推廣的重要場所。
信息咨詢與特藏部 位於圖書館北座七樓，分管信息咨詢室、海南文獻中心、外文借閱室、工具書檢索室、古籍閱覽室。主要任務是：壹、文獻的閱覽和外借服務；二、信息咨詢服務；三、本館特色資源的整理、數字化；網絡資源整序與導航；四、讀者培訓。
外文借閱室：位於桂林洋新校區公***樓壹樓，收藏外文圖書、外文期刊合訂本、外文報紙合訂本。
工具書檢索室：位於圖書館北座七樓，收藏中外文各類工具書，考研信息資料等。
古籍閱覽室：位於圖書館北座八樓，收藏古籍、特種文獻資料（地方誌）。
海南文獻中心：位於圖書館北座八樓，內設海南文獻、海南文學館、教師科研成果展廳，專櫃，收藏海南地方文獻資料（包括歷年報紙、期刊、各類圖書）、海南文學文獻資料、該校教師科研成果等。開展海南特色資源數字化建設工作。
信息咨詢室 位於圖書館北座七樓，開展參考咨詢、科技查新、文獻檢索與文獻傳遞、代查代檢等服務；對工作人員和讀者進行圖書館教育；讀者培訓、編輯《高等教育文摘》、負責網絡資源整序與導航等工作。