《南漢書》雖然晚出，但史料價值較高。該書廣泛利用了新舊《唐書》新舊《五代史》《宋史》《資治通鑒》等書，還引用了《九國誌》《十國春秋》《五國故事》及廣東地方誌等近百種古籍，史料來源豐富。對於前人記載的南漢史料，梁廷樹均細加鑒別，“事同則采其古，事異則采其詳；說有不可通則旁推曲引，務求必當”。故所載史事比較翔實、準確，可補正諸史之疏脫、謬誤。其史料價值高於《南漢春秋》及清吳蘭修所撰之《南漢紀》(成書稍晚於《南漢書》，僅記載南漢四主之事)。
《南漢書》撰成後，與《南漢書考異》十八卷、《南漢文字略》四卷、《南漢叢錄》二卷合刊為《南漢叢書》，道光十年後收入《藤花亭十種》及《藤花亭十七種》。