自16世紀《本草綱目》問世以來，歷代都有深入研究。像這樣近200萬字的巨著，即使在現代也不容易再版。但是，在這近400年的時間裏，人們對它進行了近60次的雕琢，包括現代的活字排版印刷！其重要性是可以挽回的。
近代以來，人們從現代科學包括現代醫學的角度研究李時珍的科學思想、工作方法、生平事跡、醫學成就乃至文學素養。《本草綱目》中有關博物學的學術論文多達數百篇，囊括了近代自然科學各學科的成果，研究專著更是層出不窮。李時珍成為中國古代自然科學家的傑出代表。
在國外，他的影響力也相當大。生物進化論的創始人達爾文(1809 ~ 1883)在研究和建立進化論的過程中，曾經引用過李時珍在生物學方面的成就。比如在《人類的起源》壹書中，他曾引用了壹段關於金魚顏色形成的材料，指出其顏色是由於精心的人工培育而突然變異的，指出這種動物是中國長期精心培育的，並認為它在宋代就已被培育。此材料引自《本草綱目》。達爾文曾提到，他引用的是《中國古代百科全書》，指的是《本草綱目》。
《本草綱目》很早就流傳到國外，被日本、德國、歐美的學者研究和翻譯。這麽大的壹部巨著，要翻譯成外文是相當困難的，包括很多中醫的專門術語。
迄今為止，《本草綱目》已被翻譯成英文、日文、德文、韓文、拉丁文、法文等。此外，還出現了《令狐脈沖》的德文譯本。
李時珍成為中國古代科學家的傑出代表，與羅蒙諾索夫、達爾文、哥白尼等世界著名科學家並駕齊驅。