主要由古籍與現代出版物組成，是現代佛教圖書館與特色專業圖書館的合成。藏書量滿足基本需求，涉及門類比較全面，既有古代的經史子集，也就現代意義的中文圖書分類。古籍方面，我們是全國古籍重點保護單位。
藏經閣內現有藏書量近10萬冊，寺藏古籍3萬余冊，善本古籍12000余冊。其中古籍部現存有元、明、清三代大藏經5480卷，以及少林拳譜秘籍、木刻《少林寺誌》、《明永樂南藏》、清乾隆年間嵩山書院刊刻的清紀昀《庚辰集》、清活字印本《串雅內編》、清康熙嶽生堂刊刻《說嵩》等古籍。古籍中尤為引人關註的是，有中國第壹部刻本大藏經《開寶藏》，這是目前發現的全世界第十三件開寶藏原件，是當之無愧的稀世國寶。而《趙城金藏》，全世界只此壹部，被視為稀世瑰寶。
值得壹提的是，少林寺藏經閣禪醫藥典籍、武術功夫秘籍的收藏量在全國圖書館行業處於前列。近年來，少林寺在釋永信大和尚的主持下，先後編纂出版了《中國佛教醫藥全書》《中國武術大典》《禪宗大典》等大型叢書，均存放於藏經閣內。