早在20年代，趙燏黃就認為中國藥學事業落後的主要原因是缺乏人才，而人才的根本問題是教育上重醫輕藥造成的。自清末設醫學堂以後，只註重醫學教育，藥學教育都是附設在醫學院校內。他當時執教的浙江醫藥專門學校藥科是1913年建立的，除軍醫學校藥科外，是當時國內唯壹的壹所公立醫專的藥科，曾為中國培養了壹批藥學人才。1916年，教育部舉辦全國成績展覽會，藥科獲最優等獎狀，頒“縷學宏仁”匾額，1920年，獲省教育廳全省成績展覽最優等第壹。
在杭州醫專藥科執教13年，趙燏黃壹度曾兼授藥用植物學、生藥學、衛生化學3門課程。那時這3門課程都沒有本國的教材，他每周要授課16小時，課余要收集資料，編寫3門課程的教材講義，經常工作至深夜，假日也無暇出校門壹探西湖之勝，為全校師生所稱道。
中華人民***和國成立前，他曾數次脫離教學崗位，然壹直關懷教育事業。1929年，他到中央研究院工作後，在為南京中央廣播電臺寫的《說中藥》演講稿中，批評了浙江省教育當局令浙江醫專藥科停頓近3年，再次要求將藥科建為藥學院。他到上海後，除兼任中法大學藥學專修科生藥學教授之外，還和徐伯鋆教授在《生藥學講義》的基礎上編著出版《現代本草生藥學》 （上冊）。該書除引有大量中外文獻之外，還吸收了他的生藥學研究成果，是中國第壹部收載有中藥材的生藥學教科書，改變了過去生藥學只收載外國生藥的傾向。蔡元培作序評此書“誠是壹新二千年來吾國本草學之壁壘，而其對於醫藥界之貢獻將未可限量。”藥學界公認他是中國現代本草學和生藥學的先驅者和奠基人。他在北京大學中藥研究所工作時，積極參加籌創醫學院藥學系。他以人力物力支持教學工作，生藥學教室所用之參考書、藥物標本及顯微鏡用的染色試劑都是他帶去的。經過兩年的努力，在北平建立了培養藥學人才的基地，為後來的北京醫學院藥學系打下基礎。在北平陸軍醫院期間，他除了在北平市立藥學講習所和沈陽醫學院藥學系兼課之外，還通過藥學會提案等方式呼籲政府教育部門，以北京大學醫學院藥學系為基礎建立藥學院。
1949年，他重返北京大學醫學院藥學系任教時，已年近古稀。他平生夢寐以求的願望得以實現，愈加精神煥發，勤奮工作。1950年冬，他因積勞成疾，左眼患青光眼而失明，仍帶病堅持工作，為新設置的藥學專修科擬訂教學大綱，編寫《生藥學講義》和《實用生藥學》；1953年，為生藥學專業講授《本草學》 ，他以壹生積累的本草學知識，撰著《本草學講義》，諄諄教誨學生要熱愛祖國醫藥學事業，研究中藥，壹定要鉆研本草古籍。
在教學工作中，他認真備課。《實用生藥學》講授的內容全是常用中藥，當時，沒有現成的教材，每講壹種中藥，都要參考許多書籍，證以實物標本、畫圖等等，為了保證教學效果，他課前壹定要把講義發到學生手裏。趙燏黃從事藥學教育40余年，桃李遍天下，為中國培養了幾代藥學人才，有的是中國近代著名藥學家，有的是當代中國藥學戰線上的骨幹。