在中國，《黃帝明堂經》原書最晚在宋代就已經佚失，但其內容卻被後世文獻代代相承地輯錄和保存下來。
最早引錄《明堂經》壹書的是魏晉時期的《針灸甲乙經》，但由於《甲乙經》是壹部類書，因而沒有按《明堂經》原型抄錄；唐代政府曾兩次下令重修《明堂經》：壹為甄權撰修之《明堂圖》，壹為楊上善奉敕撰註之《黃帝內經明堂》十三卷；另有楊玄操註本《黃帝明堂經》。其中，值得重視的是楊上善《黃帝內經明堂》，保留了較多《黃帝明堂經》的原始內容，遺憾的是現僅殘存序文和卷壹部分，藏於日本仁和寺中。但令人欣慰的是，即便這本書現不全，其內容已經被日本·丹波康賴所撰《醫心方》輯錄，因此現存的《醫心方》是研究《黃帝明堂經》內容的珍貴材料。
值得壹提的是，在我國敦煌出土的古代醫學卷子中，有三片針灸腧穴文獻殘頁，經日本小曾戶洋先生考證，確認是《黃帝明堂經》的壹種古傳本。
另外，根據《針灸甲乙經》、《醫心方》等文獻中保存下來的《明堂經》內容，中國中醫研究院針灸研究所黃龍祥研究員通過細致考證、校勘研究，並結合王雪苔提供的多年積累的寶貴資料，於壹九八八年將《明堂經》壹書輯復，書名為《黃帝明堂經輯校》。