關於孔子的出生，在巨野有“孔母夢麟”的傳說：孔子的祖籍在今天的河南商丘，從商丘到曲阜，巨野是必經之路。有壹次孔母顏征在跟隨家人自商丘返鄉，路過巨野的麟山，看到麟山風景優美，就提議在此歇腳。她坐在麟山上的壹棵樹下，打了壹個盹，忽然夢見麒麟入懷，醒來感而有孕，十壹個月後就生下了孔子。到孔子出生的前兩天，麒麟又到曲阜闕裏人家送去玉書三卷。在明本《巨野縣誌》中有這們的記載：“巨野南有樵氏山，世傳樵氏山產麟，麟吐玉書於闕裏，因名麟山。”
但是流傳最廣，影響最深的莫過於“西狩獲麟”的典故。到了孔子晚年，麒麟再壹次現身。《史記·孔子世家》記載：“魯哀公十四年春，狩大野，叔孫氏車子鉏商獲獸，以為不祥。仲尼觀之，曰：‘麟也’取之”。大野，就是今天的山東省巨野縣。《孔子家語》也有類似的描述，也更詳細：“孔子曰：‘麟也．胡為來哉？胡為來哉？’反袂拭面，涕泣沾衿。子貢問曰：‘夫子何泣爾？’孔子曰：‘麟之至，為明王也，出非其時而害，吾是以傷焉。’”孔子認為，麒麟是靈獸，只有君王賢明，太平盛世才會出現。現在周王室衰微，天下大亂，群雄並起，麒麟怎麽會出現呢？它的出現又死去，不是好征兆，恐怕國之將亡，自己的生命也到頭了。於是命令弟子就地掩埋，堆了個大墳堆，就是現在的麒麟冢。麒麟冢位於巨野縣城東十二裏麒麟鎮獲麟集村西北3裏處，1979年被公布為縣級重點文物保護單位。《東周列國誌》記述，七十壹歲的孔子埋葬麒麟之後感情難以控制，撫琴悲歌：“唐虞世兮麟鳳遊，今非其時兮來何求，麟兮麟兮我心憂!”他編修的《春秋》正是止於這壹年。《春秋》的最後壹句話即是“（魯）衰公十有四年，春，西狩獲麟”。從此孔子無心著述。終因傷心所致，兩年後就去世了。因為孔子夢麟而生，見麟而死，麒麟的出現貫穿了孔子的壹生，所以《春秋》這部書後來被人們稱為“麟史”，或“麟經”。麒麟從此成為孔子的化身而被尊為“聖獸”。
到了元代，在巨野又有了孔子和麒麟相關的故事。《巨野縣誌》記載，元代至正年間，巨野有壹名縣尹，名字叫孔浩，是孔子的五十三代孫。他在這裏做官三年後致仕，“上書請留”，把家安在這麒麟冢旁邊，並且修建了春秋書院。後來因為麒麟臺地地勢太窪，受水患的侵擾，舉家遷到縣城南二十多裏的吉星灘，就是今天的大義鎮孔樓村。幾年後，又取春秋“微言大義”之意，將春秋書院改為大義書院，每年春秋兩季到麒麟臺來祭祀先祖。他認為，這裏不僅埋藏著壹只麒麟，而且還有孔子的靈魂，所謂“先祖靈爽必棲於此”。孔子第五十五代衍公孔克堅撰寫的《重修大義書院碑記》裏，對這件事有祥細的敘述。現在巨野有大義鎮，鎮裏有個孔樓村，村民絕大多數姓孔，他們都是孔子的後裔。