圖書館於1959年建校時同時建立，2000年原安徽省醫藥學校圖書館並入。
基本資料：1994年，全國人大常委會副委員長盧嘉錫院士為我館題寫了館名。近年來國務院有關部委和安徽省委省政府對我校圖書館的建設和發展高度重視，多次調研並撥出專款，對我館中醫古籍收藏和整理工作給予了充分肯定。
現有東新區兩館，館舍面積1.5萬平方米，建築面積4萬多平方米的少荃湖新館已動工興建。現設采編部、讀者服務部、特藏部、技術保障部、信息咨詢部、辦公室6個部門。
現有正式職工40人，其中碩士及本科學歷27人，有中、高級職稱17人，初步形成了壹支結構較為合理的專業技術隊伍。
宗旨如下：
作為全校的文獻信息中心和為教學與科研服務的學術性機構，圖書館以"讀者第壹、服務育人"為宗旨，履行教育和信息服務職能。業務工作現已全面實現了自動化，采用分室藏書、開架借閱、藏閱合壹、電子監測、網絡管理等方式，開展外借、閱覽、參考咨詢、信息檢索、讀者教育、文獻復制等全方位信息服務。
以上內容參考：百度百科-安徽中醫藥圖書館