關於巴國的都城，《華陽國誌》說：“巴子時雖都江州，或治墊江，或治平都，後治閬中。”“江州”即今重慶市區，“墊江”今合川，“平都”今豐都，“閬中”古今皆同。巴人何以不斷改變國都的地點呢？這可以用巴人由長江三峽西進，最後退守至閬中而國亡的歷史內涵來作解釋。就是說，巴人最先從奉節西進，曾壹度在今豐都立國，後因楚的勢力不斷進逼，又才被迫西徙今重慶市區，建都於此。
巴人在今重慶市區建都，除了有文獻上的記載以外，地下出土的文物更是壹種實證。遠的不說，八十年代中期，考古工作者曾在渝中區千廝門壹帶，清理出土了屬於戰國時代的巴人青銅兵器，有柳葉形劍、弩機、箭鏃等。更重要的發現是五十年代初修築成渝鐵路時發現的，當時在今九龍坡區的冬筍壩出土了具有巴文化特點的二十余座船棺墓葬，有用整段木材挖鑿成的獨木舟形木棺，青銅兵器劍：鉞、矛、戈等。現在可以推定，冬筍壩船棺墓葬群，是當年戍守巴都西大門的兵吏們的墓地。
戰國中後期，由於楚國勢力的不斷西進，形成了“江州以東，其人半楚”的局面。巴國君臣不得已把都城向西北遷移，先是駐今合川，後又稱都閬中，最後於公元前316年滅秦。