周乃玉在痹癥的治療上，辨證立法註重臟腑辨證，強調體質內因的致病因素，主張扶正祛邪，調整臟腑功能的治法；分析病因病機中強調痹癥的外因多為“寒濕、濕熱、濕毒”，內因為臟腑陰陽失調，病機以風寒濕為標，脾腎陽虛為本，寒熱錯雜，虛實相兼；在痹癥治療上，運用整體觀臟腑辨證，六經辨證，調氣調血，化痰逐瘀，疏經通絡，辨病辨證相結合，周老師臨床精研古籍，擅長經方活用，特別深究《傷寒論》和《金匱要略》，對柴胡加龍骨牡蠣湯、柴胡桂枝湯、四逆湯、真武湯、風引湯、白虎湯、陽和湯、薏苡附子敗醬散等運用純熟，在臨床施治過程中每每獲得奇效。她在長期臨床實踐中自創“痹玉康”、“痛風平湯”、“健脾益氣通陽湯”等經驗方，臨床療效顯著。在用藥方面，她推崇補陽之品，慎用蟲類藥，且配伍匠心獨具。