哈紮拉人有8%左右的東亞血統。
壹些基因研究顯示，在哈紮拉人中，占比最高的父系基因是C3，而擁有這種基因的人群在說蒙古語的人群和說哈薩克語的人群中比較常見。但C3在哈紮拉人的父系基因中也只是占到了40%左右，另外還有30%多則是西歐人中常見的R1b1b。
此外來自東北亞的Q1和O3也都分別占到了8%左右，而O3可以說是漢族人群中最常見的父系基因分型，在漢族人口中能占到50%以上。而在母系方面，哈紮拉人的基因裏也有35%左右來自東北亞，另外65%則是西歐和南亞常見的類型。
人種的起源：
哈紮拉人的起源更為久遠，他們可能是中國古籍裏提到的大月氏人西遷之後的壹支後裔。另外，這種觀點認為，大月氏人本身也有壹些漢藏語族諸族群的血統，而這些可能就是哈紮拉人父系基因中O系基因的來源。
還有觀點認為，黃種人才是阿富汗地區最早的原住民，而目前阿富汗的各個白人族群其實是較晚才遷來的，而哈紮拉人則是當地黃種原住民在現代最後的遺存。另外壹種觀點則認為，哈紮拉人本身並沒有明確的形成時間和先祖族群，他們就是在漫長的歷史長河裏由曾經到過當地的不同黃種和白種族群長期混血形成的壹個民族。