《易經》為五經之首，是儒道乃至諸子百家學術思想***同的來源，也是中華文化的根本思想。要真正認識中華文化，不可不了解《易經》。然而，易理艱深，讀者每視為畏途，有誌者或不得其門而入。懷師的《易經雜說》從“變易、簡易、不易”和“理、象、數”這些基本法則入手，將《易經》知識娓娓道來，如數家珍，把有誌學易者引入門徑。《易經系傳》是孔子研究易經的心得報告。懷師在另壹部易學講稿《易經系傳別講》中，不僅對《易經》有更精辟的講述，也透過對《易經系傳》的分析，深入探明孔孟思想、儒家學說的文化源頭。內容涉及自然哲理、人文精神、政治藝術以及身心修養之道。
懷師的儒學著作有5個鮮明的特點：壹是以經解經。也就是將唐宋以後的批註推開，依靠熟讀原文來理解儒家經典。因為在這些經典中，前文的意思往往在後面的語句中就有清晰的解釋。只要前後篇章，貫而通之，就自然能理解經典作者原來的思想。《論語別裁》的寫法基本上就是運用了這種以經解經的方式。
二是經史合參。也就是將儒家經典與相關的歷史記載對照、比較、融會，來參究經典作者當時所表達的思想。如《論語別裁》以《論語》與春秋時代的史跡相融會，看到當時社會、政治的混亂面貌，以見孔子所開創和確立的文化精神之偉大。《孟子旁通》以《孟子》7篇本經結合戰國時代相關歷史資料，來說明孟子存心濟世的精神所在。
三是旁征博引。懷師幾乎在每壹種著作中都以其淵博的知識，包羅諸子百家思想精華，融會中外古今學說於壹爐，且往往能觸類旁通，解答令歷來名儒卻步的難題。例如，《大學》中提及的“知、止、定、靜、安、慮、得”七個修證層次，是先秦時期中國傳統文化中教化學養的特色，也是儒家心傳的修養功夫。雖然這“七證”對後世影響甚巨，但《大學》中並未具體說明如何實踐。宋明以來的理學家囿於門戶之見，而無法疏解清楚。懷師在《大學微言》中借用佛道兩家學術來闡明“七證”功夫，因而超越前人的見解。
四是深入淺出。懷師講課寫書都喜歡把深奧的道理說得明白易懂，態度平易近人，語言機智幽默。例如，以往《易經》總是給人壹種神秘玄妙、莫測高深的感覺。懷師的兩本易學著作則以獨特的妙悟勝解，把高深的易理說得人人能懂。通過懷師的講解，讀者會發現《易經》其實是壹門很平易的學問。
五是貫通古今。“通古今之變，成壹家之言”是懷師儒學著作的最大特點。在他看來“四書”、“五經”都有超越時空的價值，但理解這些經典不能泥古不化，而要結合時代的變遷。在《論語別裁》和《大學微言》中，懷師不但每每聯系今人今事幫助讀者理解經典作者思想，而且經常比照現代世界文化潮流，指明自己民族、國家今後應該要走的路線和方向。因此，懷師的著作填平了古今文化隔閡的溝壑，成為當代中國人了解傳統文化的橋梁。
全集的第二類是佛學著作。這部分著作所占數量最多，包括《禪海蠡測》等17種。佛教是對古代印度文化的壹次系統總結和重大變革。它在漢代傳入中國以後，與中國本土的儒家、道家文化相接觸，經歷了壹個由沖突到融合的過程，逐漸成為中國傳統文化的重要組成部分。可以說，六朝以來的中國文化已是儒、佛、道三家匯合而成的文化形態了。因此，了解中國傳統文化，離不開對佛教的研究。
佛教在今天這個世界仍有其重要的存在價值。在當前這個時代，全人類都以現代化為社會目標。現代化雖帶來了物質進步，但也造成了社會病態。現代化的基調是理性化，理性主義獲得最有力的表現是科學和技術。根源於科學的技術實際上塑造了現代世界的性格。德國思想家馬克斯·韋伯稱這種現代理性為“工具理性”，因為它只涉及達致具體目標的手段和工具的合理性，卻根本無視生命的價值問題。德國法蘭克福學派的當代代表赫勃瑪斯指出：“工具理性之高揚，導致科技意識之橫決，已造成生命世界的殖民化。”在當今世界，人為追逐物質財富而忙碌，自己則迷失在忙碌之中。人們逐漸把自己異化成物，生命成為物的附屬品。人們與自然疏離，與社會疏離，與家庭疏離，也與自己疏離，割斷了與精神家園的古老聯系。人們在表面上仍舊把幸福、成功或創造視作生活的目標，但實際上已沒有目標。人們愈益被空虛、焦慮、煩躁、寂寞、孤獨和絕望所煎熬，產生壹種被美國社會學家彼德·勃格稱為“心靈的飄泊”的感覺。因此，如何安頓人的心靈，對完美人生來說已越來越重要。
此時，人們猛回頭才重新發現宗教對人生的意義。宗教，唯有宗教才可以滿足人類超越自我，追求永恒、圓滿、至真、至善、至美的心理需求。這是壹切宗教***同具備的功能。因此，人的宗教精神可能改變自己的存在形式，但它是不會消失的。西方基督宗教主張依靠上帝的拯救，實現這種超越。但“上帝萬能”觀念在現代理性精神沖擊下已經崩潰。人們不再認為地球是宇宙的中心，上帝創造世界、創造人類，上帝甚麽都能做，甚麽都可以做。用尼采的話說，就是“上帝死了”。人們可以放棄上帝這個“拯救者”的幻象，卻不能沒有宗教精神，放棄超越自我的精神需要。佛教沒有這個“拯救者”概念的拖累。它教人自尊自信，依靠自己的力量從生死痛苦中解脫出來。因此，佛教能夠擔負起安頓人心、提升人生價值的使命。這就是今天佛教由東向西，逐漸在全球廣泛傳播的根本原因。
懷師的17種佛學著作，大致可分成佛經釋義、禪學、佛法修證等三部分。佛經釋義包括《楞嚴大義今釋》、《楞伽大義今釋》、《圓覺經略說》、《金剛經說甚麽》和《藥師經的濟世觀》5種。由於以往流傳的漢文佛經大多是唐代以前所譯，文辭古奧，語意晦澀。何況時歷千載，理解闡釋，古今完全異趨。因此，壹般讀者皆感到佛經難讀，常常望而生畏。然而，這些佛經壹經懷師講解，就變得明白易懂，為各種文化層次的讀者喜聞樂見。懷師講解佛經的特點是：揉合翻譯和解釋，壹方面在保持原文字句意義的前提下，采用現代語言來述說大義；另壹方面用現代事物理則來解釋佛法精要。例如，懷師推薦《楞嚴經》為全部佛法綱要。這部經典有條理、有系統地概括了佛法的中心要義。不僅給利智者指明直指人心、見性成佛的法門，也為鈍根者道盡修行證驗方法與次序以及種種方便。古賢稱：“自從壹讀楞嚴後，不看人間糟粕書”。可見《楞嚴經》在中國傳統文化中的地位。懷師指出，《楞嚴經》從七處征心與八還辨見開始，逐層深入、條分縷析地講明心物壹元的原理。懷師在《楞嚴大義今釋》中對此作了現代闡釋，說明《楞嚴經》是如何從身心的實驗去證明物理世界的原理，又如何從物理的範疇指出身心解脫實驗的理論和方法。告訴我們：佛教所說的心物壹元，不僅是壹種思想理論，而且是基於人們實際心理情形，可加以實驗證明的。因此，佛教確實有科學的證驗和哲學的論據。
當然，佛經的難讀不僅在於文字，許多佛經更因其內容博大精深，倘不能通達因明，善於分別法相，精思入神，並從真修實證入手，會之於心，實在很難窺其堂奧。例如，《楞伽經》被公認是最難讀的佛經之壹。蘇子瞻曾言：“楞伽義趣幽眇，文字簡古，讀者或不能句，而況遺文以得其義，忘義以了心者乎。”懷師精研法相唯識，對《楞伽經》下過壹番苦功，慎思明辨，嚴謹分析，歸納論據，融會於心。因此，他在《楞伽大義今釋》中，為讀者清晰地理出此經頭緒：經中首先借大慧大士之口，提出108個人生思想哲學問題，但佛陀並沒有壹壹作答，而是直截了當地說心、說性、說相，對五法、三自性、八識、二無我分別加以辨析，然後引向形而上的第壹義諦，指出壹個心物實際的如來藏識作為總答，指示空有不異的事理，說明理論與修證的實際。可見《楞伽經》宗旨在於直指人生的身心性命，與宇宙萬象的根本體性。經懷師壹點撥，楞伽奧義昭然若揭。
懷師講經不僅為讀者理清脈絡，而且往往點明重點，方便研讀。例如，在中國文化中，《金剛經》是影響很大的壹部佛經。它的獨特之處在於超越了壹切宗教，又包含了壹切宗教，不局限於佛教的範圍。千余年來，無數人研究金剛經，念誦金剛經，因金剛經而得道，金剛經的奧秘何在？懷師在《金剛經說甚麽》中指出：此經的重點在善護念，這是由凡夫到成道之路，聖人和凡夫同壹個修持的方法。護甚麽念？學佛就是證道，壹切佛所證的，那個最高的境界叫涅盤。涅盤不是死亡，涅盤是圓滿，不生也不死，不來也不去，永遠是清凈。怎樣護念？應無所住，不生法相，如如不動，不取於相，就是保持內心平靜的這壹念。縱然在動亂中，也在清凈，如如不動。又如，《藥師經》是壹部通俗但並不易懂的佛經。懷師在《藥師經的濟世觀》中點明：藥師佛12大願是此經重點，顯示了救人濟世的大乘精神之偉大。讀者把握了這個重點再讀《藥師經》就容易讀懂了。再如，《圓覺經》是壹部指引眾生如何修行成佛的了義經。此經記載釋迦牟尼佛答復12位菩薩所提的問題。這12位菩薩各有不同的表相，代表著12種修行法門。懷師在《圓覺經略說》中將如何明心見性，如何修止、修觀和修禪那的重點壹壹提示清楚。懷師在講解佛經時，常常列舉大量的例子來說明道理。在《圓覺經略說》中，講到見地、修證、行願都詳細舉例說明。很多例子就是懷師自身的經歷。在《藥師經的濟世觀》中，懷師往往以親生經歷舉例，融會經義來講解，因而即使深入到極細微處，也使讀者必能有所領悟。
懷師的禪學著作包括《禪海蠡測》、《禪與道概論》、《習禪錄像》、《禪話》、《禪宗叢林制度與中國社會》等5種。當然，佛法修證部分的著作也大多與禪學有關，只為敘述方便而另列之。兩宋以降，禪宗漸成佛教主流。天下佛徒稱習禪者無計其數，佛寺號禪林者觸目皆是。然大多數人對何為禪宗宗旨卻渾然不知，有以枯坐不動為禪宗者，有以遊戲文字為禪宗者。當今之世，像懷師這樣通義理、有修持的禪者已絕無僅有。因此，如果只就這方面的成就而言，說南懷瑾是當代的禪學大師也是當之無愧的。
《禪海蠡測》是懷師最重要的禪學著作，不僅紀錄了懷師畢生習禪的心得，也是壹本禪宗正本清源、撥亂反正之作。懷師開宗明義地點明：禪宗以明心見性，洞達法性為宗旨。廣征博引，直斥各種文字禪、知解禪和口頭禪，直探禪宗的活水源頭。懷師著重闡明了禪宗與教理、頓悟與漸悟的道理。佛法在中國大致有十宗之分途，禪宗以外各宗皆依教理（經、律、論）而言修證，唯有禪宗標榜“不立文字，直指人心，見性成佛”。後來禪宗之徒以為可以廢棄教下經藏之學而悟道。其實，禪宗與教理的關系是“言其理則，佛說三藏十二分教，皆為所依。推其極致，則壹字不立，揚眉瞬目，已是第二義事矣。”懷師指出：禪宗的古德，雖然不壹定是先由學習教理而入禪，但大多數也都於悟前或悟後通曉義理，融會心宗。因此，習禪者不能忽視研習佛經，應當溫故知新，融通諸說。
當初禪宗所以標榜“不立文字”，是希望擺脫教條，以獨特的方法給陷入種種文字名相戲論中不能自拔的佛徒打開思想活路，進入壹個充滿自信和活力的世界。及至唐宋禪門活法已成死語，故諸家宗祖，不得不別標心法，如參話頭、看公案、擎拳、棒喝等，以勘驗學人，錘煉其知見。但後世習禪者舍本逐末，老死話下，永無出期。懷師有鑒於此，故不以話頭為實法，不以棒喝為家風，回歸禪宗活潑潑的本來面目。
禪宗自五祖弘忍門下有南北分途，南宗主頓悟，北宗主漸修。後世南宗風行天下，習禪者以為禪宗法門不需坐禪，只須於壹機壹境上驟然悟得，就可以得道了。懷師指出：“盡壹大藏教，統諸修行法門，皆漸法耳。即禪宗祖師，於言下頓悟者，亦由熏修漸積而來。”因此，習禪者必須註重修定。至於是先修後悟、修悟同時，還是悟後起修，懷師認為：三說雖異，通途是壹，根器各異，自知適應，不必爭論高下。懷師的禪法不僅融合佛教顯密之學，而且貫通儒、道各家之言，相較比量，會歸壹旨，別開生面。
《習禪錄像》是懷師歷年主持禪七的開示語錄，及十方來學的修行報告。假此文字因緣，讀者或可壹睹真正的禪門風範。禪七用意在克期取證，以求明了生命之真諦，生死輪回之原因，進而超越生死。懷師參照禪密，采用唐宋方法，因眾生習氣煩惱各有不同，打破傳統打七方法，嘻笑怒罵，因人施教。讀者如能將此書與《禪海蠡測》結合起來讀，對懷師的禪學思想與造詣會有更深壹層的理解。《禪與道概論》的前半部敘禪宗宗旨與宗派源流，以及禪宗對中國文化之影響。《禪話》深入淺出地介紹歷代禪門公案，堪稱壹部通俗禪宗史。《禪宗叢林制度與中國社會》則詳述禪宗叢林制度的特點、起源和演變。這3種著作從不同方面介紹有關禪宗的知識。
佛法修證著作包括《靜坐修道與長生不老》、《定慧初修》、《壹個學佛者的基本信念》、《禪觀正脈研究》、《如何修證佛法》等5種。學佛不同於學習其它知識，不僅要研讀佛學理論，而且必須親身實踐。見地、修證及行願是學佛修行必須依持的綱要，且三者密不可分。懷師在《壹個學佛者的基本信念》中指出：行願是修學壹切佛法的基礎。壹個學佛者必須把信念建立在普賢菩薩般的大行大願上，才能突破來自多生累劫的罪障惡業，成就菩提道果。他在書中深入淺出地闡述了《華嚴經·普賢行願品》的密義，公開了普賢行願的修持法門。《如何修證佛法》是懷師最重要的著述之壹，對學佛修證的實際步驟有精辟的講解及具體的指引，對修持路上的迷惑、歧路以及不自覺的錯誤都壹壹糾正。《定慧初修》是懷師傳授止觀、修定、修慧的講記，適合初學者。其中，《觀無量壽佛經大義》著重介紹修凈土法門的入門知識，闡述了凈土與禪、唯識學的關系，消除修凈土只是有口無心念佛號的誤解。大乘必須以小乘作基礎，小乘的修法是甚麽？懷師在《禪觀正脈研究》中，以《禪秘要法》作底本，教授白骨禪觀修法。經過這個觀法的修持，我們身體不凈的本相就會如實呈現心中，有助破除身見，進而見到空性。《靜坐修道與長生不老》是有關靜坐修持最權威的著作。懷師在書中融合儒、釋、道三家靜坐的原理，吸取藏密氣脈、明點諸法的知識，配合中西醫學，評述古往今來各門各派修道者的修持經驗，傳授正確的修定方法，解答氣脈反應變化的各種問題。懷師對佛法修持的傳授於今是獨步天下的。他不僅融合了佛教顯密，儒釋道三家，中西醫學，宗教、哲學與科學等各方面知識，更重要的是他有數十年親身修持成就的功夫。懷師的禪定功夫是經過科學鑒定的。臺灣的鐵路醫院骨科主任周孝儒醫師和中興醫院麻醉科主任張慶灼醫師曾使用測試儀器，對懷師入定時的生理狀態進行測試。結果發現他的心電圖上呈現壹條直線，不再有上下波幅。科學證明禪定境界的“氣住脈停”確有其事。
此外，收入全集的懷師佛學著作還包括《中國佛教發展史略述》和《道家密宗與東方神秘學》兩種。《中國佛教發展史略述》是壹本簡明的佛教史，從印度佛教起源，談至佛法傳入中國後的經過，以迄於當代世界各國的佛教現狀，對了解佛教歷史淵源提供了清晰的線索。《道家、密宗與東方神秘學》介紹有關《易經》、中醫、神仙丹道以及西藏密宗的原理，闡述密法真義，道破宗教神秘儀式之假象。誠如懷師所言：在人類文化中，神秘學自古相傳至今，似宗教非宗教，似哲學非哲學，亦宗教、亦哲學。中國作為有悠久歷史文化的文明古國，是神秘學的策源地之壹。以往神秘學因其神秘莫測而流行，人們往往牽強附會、妄引仙訣法要，甚至借此聚眾斂財。倘能發揚科學精神，去偽存真，去蕪存精，仍能從中發掘許多寶貴的文化遺產。
全集的第三類是有關道家學術的著作，主要是《老子他說》和《中國道教發展史略述》2種。此外，前述《禪與道概論》、《靜坐修道與長生不老》和《道家密宗與東方神秘學》等佛學著作中，也有部分篇章是談道家學術的。道家文化是中國傳統文化的主流之壹。道家學術自老、列、莊諸子以下，“綜羅百代，博大精微”。自兩漢後，道家壹變而集於道教，因其“綜羅百代”之故而不免生“雜亂怪誕，支離破碎”之弊。因此，到了近代社會，學者往往把道家文化視為迷信，更有壹班孤陋寡聞者臆斷道教本身沒有思想學術，只是對佛教的抄襲而已。懷師早年曾鉆研道家學術，深得其中三昧，因此對道家文化頗為推崇。他曾說：在儒、佛、道三家中，佛家是偏重於出世的，雖然佛家的大乘道也主張入世，普救眾生，但出家修道的人本身還是偏重於出世；而且佛家的學問從心理入手，然後進入形而上道。儒家的學問，又以孔孟之學為歸趨，則是偏重於入世的，雖然像《大學》、《中庸》亦有壹部分出世思想，但到底是偏重入世，從倫理入手，然後進入形而上道。道家的學問，老莊之學就更妙了，可以入世，亦可以出世；或出或入，都任其所欲。在個人的養生