學術出版方面，在漢語言文字研究、歷史學研究、哲學研究、古籍整理、唐詩研究、中國社會科學基金項目文庫、徽學研究、第二語言研究等專業領域形成了壹定的影響，獲得國家級、省部級獎58項。先後有《劉文典全集》、《唐詩風貌》、《李商隱詩歌研究》、《金代文學研究》、《唐刺史考全編》、《明代徽州方氏親友手劄七百通考釋》、《詩情畫意的安徽》、《徽州宗族研究》、《李商隱傳論》等圖書獲得安徽圖書獎；《出土夷族史料輯考》於
2007獲首屆中國出版政府獎提名獎。
2010年5月，國家出版基金資助項目、“十壹五”國家重點圖書出版物出版規劃項目《陳垣全集》順利完成全部出版工作，壹代史學大師的學術遺產能更集中地為後人使用。
2014年，安徽大學出版社獲批為國家社會科學基金規劃項目後期資助成果出版基地，是安徽省出版界首批獲批的出版社。截至2015年3月，安徽大學出版社獲得中國出版政府獎、中華優秀出版物獎、“三個壹百”原創圖書出版工程獎、安徽省政府獎等各類國家級、省部級獎項102項；列入“國家出版基金資助項目”“十二五國家重點圖書出版規劃項目”“2011～2020年國家古籍整理出版規劃”“經典中國國際出版工程項目”等各類國家級、省部級項目50項 。