建立了以人文、社會科學、理學、工程技術科學、醫學、地質科學和信息科學文獻為主體的多種類型、多種載體的綜合文獻資源體系，覆蓋了人文社科、理工農醫軍等全部十三大學科。藏有各類紙質書刊585萬余冊，其中古籍40萬冊，古籍中6000余部為善本。地方誌與譜牒、金石拓片與古文字文獻的收藏在高校圖書館中名列前茅。訂閱外文期刊1268種，中文報刊4914種。圖書館註重數字化文獻資源的建設，購買了包括web of science和EI在內的48種西文文獻數據庫，中國知網等14種中文數據庫，超星、書生等電子圖書140萬冊，自建了東北亞研究、地學、汽車、滿鐵資料等12個數據庫。
圖書館的自動化、網絡化、數字條件實現了跨越式的發展，2000年引入了美國SIRSI自動化管理系統，統壹了五校區各專業圖書館管理軟件，實現各校區資源***享，為讀者提供全流通、開放式的服務。圖書館實現了萬兆核心交換機、千兆匯聚層交換機、百兆桌面的網絡環境，基於校園網絡實現了大規模並發用戶的訪問和全年365天、每天24小時的全天候遠程服務。
吉林大學圖書館現是中國高等教育文獻保障系統（CALIS）東北地區中心，大學數字圖書館國際合作計劃（CADAL）項目成員館，中國高校人文社會科學文獻中心（CASHL）東北區域中心，教育部引進文科圖書中心書庫，教育部化學學科外國教材中心，文化部第二批全國古籍重點保護單位，教育部科技查新工作站，吉林省高校圖工委秘書處所在館。 東北亞研究數據庫汽車工程信息數據庫
滿鐵資料庫 亞細亞文庫
古籍音韻庫 古籍部 古籍文獻庫 國土資源管理與執法電子圖書庫(校園網用戶)
東北地區地學文獻數據庫國家自然科學基金資助項目（地球科學部分）數據庫(校園網用戶)
EI/SCI/SSCI收錄外刊目錄(校園網用戶) 吉林大學EI論文收錄數據庫
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