具體來說，成化五年(1469)，明憲宗朱見深免去韓雍兩廣總督之職，但仍兼任兩廣總督，專事軍事。自此，總督軍務正式全職化。兩廣總督官制最早要追溯到景泰三年(1452)，但這壹時期總督建制並不穩固，不時被撤。
兩廣總督
巡撫真正成為地方官、省官是在清朝。明代總督本質上是中央派出的欽差大臣，地方政府的日常事務由三個部門(承辦宣傳部署政府的部門、緝拿罪犯的部門、指揮使臣的部門)管理。
兩廣總督的本意是，明朝中葉，兩廣民族矛盾日益尖銳，連瑤人、同人都造反了。為了有效鎮壓起義，維護地方統治，明政府設置了專門的總督，並派遣中央官員到地方監督和處理民族問題。據明代《王奧傳》記載，王奧曾任兩廣總督。在任上，王奧采取了不同於以往的策略。他不是單純依靠武力來鎮壓對瑤民和子弟的反抗鬥爭，而是“制伏官吏，推誠安撫訓令，瑤民轉事，部內無事。”
兩廣總督林則徐
在清朝，總督成為該地區的最高軍事和行政長官。對於兩廣，清政府也設置了巡撫行使管轄，但最初並不命名為“兩廣總督”。壹是順治元年設廣東巡撫，同時兼管廣西；到順治18，廣東巡撫主政廣東；康熙四年，改為兩廣總督；雍正元年，再次被調整為廣東巡撫，負責廣東；雍正二年，重新調整為兩廣總督；雍正六年，任廣東巡撫；雍正12年改稱兩廣總督，清末至今未變。但在光緒31年，兩廣總督也是廣東巡撫。
清末以後兩廣總督權力很大，在地方官員中排名很高，壹般都是次等。此後，乾隆十四年，授都察院右禦史，乾隆四十八年，授兵部尚書。在清代九個地方官中，廣東巡撫位列第四，僅次於東北三省、直隸、兩江巡撫，其次是閩浙、湖廣、陜甘、川滇、貴州巡撫。
兩廣總督都是歷史上有名的人物，其中我們比較熟悉的有:虎門滅鴉片，官至壹品的林則徐；淮軍創始人、洋務運動主要倡導者之壹李鴻章；與此同時，禮部禮部尚書、兩江總督兼通商事務大臣、曾國藩的弟弟曾國荃；洋務派代表人物，晚晴四大名臣之壹張之洞等。
兩廣總督張之洞