《肘應急方》認為“傷寒、溫病、溫病同病”，即傷寒、溫病、溫病同病。
書中提出“治瘴氣、疫疾、疫熱方藥”壹章，記載了治療和預防疫熱的方藥，如肝散、老君沈明散、毒痹散、痞瘟散等。
《肘急方》還倡導“未病先防”的預防思想，記載了多種預防瘟疫的方法，如口服藥物、擦身、接鼻、放耳門、戴、掛、灼、熏等。其中，空氣消毒和飲用水消毒是專門為消毒設計的兩種處方。
此外，《肘後備急方》還主張用各種外治法治療疫疾，防止疫疾的發展和蔓延，包括導引(如八段錦、太極傳、六字訣、易筋經等。)、壓高蹺(以手壓為主按摩，以腳壓為主按摩)、針灸、艾灸(灸)、拔罐等方法。
肘背急救處方，原名肘背搶救處方，是我國第壹本臨床急救手冊。東晉葛洪撰，作者根據其原著《方雨涵》(卷***100)摘錄的可用於急救醫療的單方和簡易灸法整理而成。“肘後”壹詞有便於攜帶、取用方便的意思，而“以備急用”壹詞則有容易取得藥物、就地取材的意思。