由於南朝勢力衰落,奪取京都,對抗室町幕府支持的北朝,是不可能完成的任務。主張與北朝和平融合的合議勢力逐漸主導了南朝的政治主流,南北朝的融合成為歷史的必然。南北聯合的實質是朝鮮貴族向室町幕府的武氏政權投降,被武氏控制的朝鮮吸收。
因為南北融合很大程度上是室町幕府將軍足利義光戰略的結果,融合過程中達成的很多協議後來都被幕府忽視,兩統壹原則被拋棄。舊南朝的憤懣勢力在接下來的90年裏壹直在為恢復南朝的榮譽而奮鬥。這些參差不齊的叛軍,壹般被稱為後南朝勢力。