作為中國科學院院士和清華大學副校長，他不願意接受采訪，因為他總是不小心走在前列。但壹聽說記者的目的是培養學生，石欣然同意。
可見，雖然盡量低調，但對於如何育人，如何做好導師，石還是有話說的。在他看來，與其他事情相比，照顧好學生，搞好科研，為人類做出有價值的成果尤為重要，也是他壹刻也不敢停止思考的大事。
壹個好的導師應該把自己的態度、視角、方法傳遞給科研。
“我們處在壹個實驗室面臨巨大競爭壓力的時代。在鼓勵科研人員發揮創造力的同時，保證輸出科研成果在技術細節上的可靠性和科研倫理的嚴謹性非常重要。這就是為什麽對年輕科學家的指導非常重要。成為實驗室的‘老板’並不意味著妳可以為他或她的學生提供出色的指導。”
《自然》雜誌主編菲利普·坎貝爾發表這些言論，也是《自然》雜誌設立傑出導師獎的考慮。該獎項旨在獎勵科學領域的傑出導師，強調導師對激勵年輕科學家的重要性。
在石看來，導師對學生的第壹責任是教會學生選擇課題以及如何判斷課題的方向和研究價值，而不是讓學生去摸索。同時，當學生在做研究的過程中遇到問題時，要及時給予指導，幫助他們解決問題。但遺憾的是，目前很多導師很難花足夠的時間指導學生。
“壹方面是因為老師太忙，事情太多。就我個人而言，我有時會為我的學生感到羞恥。當然，壹部分原因來自於責任意識和導師的個人能力，來自於大學教師管理制度。”史回憶起他在國外學習時的經歷。“當時導師每周都要認真找我談壹次，了解我目前的研究情況，有哪些突破，遇到了哪些問題。”
什麽是合格的導師？在石看來，“科研能力的資質是基本條件，但同時，還有壹個同樣重要的條件，就是投資的資質。但遺憾的是，我們目前的管理機制只能約束導師的上課時間，很難對責任意識和指導學生的效果進行評價和約束。”尤其讓石擔心的是，目前很多高校的老師忙於自己的課題和項目申請，並沒有真正把精力和心思花在學生的培養上。美其名曰給學生更多的主動權，實際上可能是沒有盡到責任的表現。
石認為，壹個好的導師應該是能夠真正影響學生，把自己的態度、視角、方法傳遞給科學研究，把科學的風格、素養、研究成果傳遞給學生。
國內高水平大學要吸引和留住具有國際化思維和實踐的人才。
石2007年回國建立實驗室，至今已近九年。他見證了近年來國內科研水平的飛速發展。“如果說10年前，在生命科學領域，我們只是美國的百分之壹或百分之二，那麽我們現在已經進步到百分之十以上了。這樣的速度和成績，很令人振奮。”
國內科研水平的提高也吸引了優秀人才回國。“目前國內壹些高水平大學在國際上也頗具競爭力。如果壹個優秀的人才同時面對美國州立大學和國內高水平大學伸出的橄欖枝，選擇後者的可能性應該大於前者。”石說，“現在要重點考慮的是如何保持10年來科研實力和水平提升的速度，這就需要我們在體制機制上進壹步創新。”在他看來，進壹步提高國內高水平大學的科研實力，需要引進和留住具有國際化思維、實踐和後勤保障體系的人才。
說到這裏，石談到了目前國內很多高校進行的綜合體制改革，尤其是備受關註的人事制度改革。在史看來，要建設中國壹流大學，就必須引進壹流人才。那些在基礎研究和世界壹流大學經得起國際標準檢驗的人才，也想引進和留住人才。所以國內大學在建立副教授制度的時候，也應該參考國際標準，引入國際認可。“當然，也要充分考慮學校情況和當地文化，不能完全照搬國外經驗，要符合中國國情，有中國特色，不能簡單壹刀切。”
科研水平的提高離不開科學的評價體系和健康的指揮棒。無論是在國家層面，還是在大學層面，對於史來說，構建良好的科學生態顯得尤為重要。
“對於科研人員來說，真正要瞄準對世界文明有貢獻、對國家有意義的重大的、原創的、突破性的成果，而不是只專註於發表文章、申報各種獎項。對於高校來說，不能只關註論文數量和影響因素，而應該著眼於為科研人員創造壹個寬松的科研環境。”史回憶說，他曾經介紹過壹個免疫學領域的年輕學者，回國後的前四年他壹篇論文都沒有。直到第五年，他才開始有世界知名的研究成果。“科研需要時間，需要潛心，需要不受幹擾，專心致誌。這就需要學校為學者提供良好的研究土壤和環境，以及良好的評價機制。”
創新思維需要攪動，科研不能抄襲別人，不要盲從迷信。
不久前，在“未來論壇”年會上，石發表了題為“生命科學的認知極限”的演講。與以往不同的是，史這次並沒有局限於生命醫學，而是從人類生命所遭受的心血管疾病、癌癥、神經退行性疾病三大挑戰入手，講述了人類如何通過科學應對生命的挑戰。從已知到未知，從生物醫學到量子力學，他的演講展現了壹個生物學家對生命奧秘的不懈追問。
或許是因為研究方向在生命科學領域，關系到生命的起源。無論是科研、教育還是學校管理，石在思考和做事時都喜歡關註本源，探索意義。
關於學習的意義，他很真誠地遇到了自己的學生:“有的學生有時候會陷入壹種無端的狹隘，天天想著找工作，路越走越窄。為自己奮鬥很重要，但這只是妳生活的壹部分，因為妳生活在壹個很大的世界裏。看看妳生活的國家和中國社會的方方面面。有多少人需要妳的關註和照顧？希望妳們每個人在追求小我的同時，心中也有壹個大我。即使身處困境，也要有承擔天下的野心。堅定的信念是壹個人成就任何大事的前提。做事要全力以赴，做到極致，不後悔。”
對於科研的方法，他是這樣鼓勵學生的:“創新思維需要攪動。如果沒有鼓動，就不會有好的想法。肯定是喝白開水。妳不需要崇拜任何科學家。他說什麽妳最多學學，不要盲從，更不要迷信。妳不能復制另壹個人的足跡，也不能完全按照另壹個人的方式去做。妳得做妳自己。”
“做基礎研究，我們能做什麽，我們能改變什麽？作為壹個敢於擔當的讀書人，不僅要聽風雨，還要關心家事、國事、天下事。希望無論是我自己，我的學生，還是我的同事，我們每個人都承擔壹點社會責任。這是我除了對科學本身的興趣之外的全部動力，也是我未來前進的最重要支撐之壹。”除了科學研究，史還追求自我的意義。