該工程位於學校東區(梅山路103號)圖書館南樓二層，建築面積320m2，框架結構。改造成了普通書庫、珍本書庫、古籍閱讀三個部分。
安徽中醫藥大學圖書館在1959建校的同時成立。2000年，原安徽醫學院圖書館合並。