如果用戶引用的參考文獻格式設置正確，查重系統不會計算參考文獻的重復率，而是計算參考文獻的引用率。
當查重系統檢查參考文獻的重復時，它將首先識別參考文獻的引用格式。如果格式正確，查重系統會將參考文獻的內容與引文庫的內容進行比較。如果內容壹致，查重系統會將該部分作為參考進行判斷，不會計算其重復率。
因為論文的引用部分需要有壹定的正確格式，如果格式不正確，那麽查重系統就會認為這部分內容是自己寫的，然後去新系統文獻庫進行查重，這樣就容易出現紅。所以大家壹定要修改論文的格式，否則查重過程中可能會出現問題。
紙張查重的原則:
知網學位論文是作為整篇文章進行檢測的，格式可能會對檢測結果產生影響。需要提交最終的提交格式進行檢測，將影響降到最低，影響幾十的小段可能檢測不到。超過3萬字的論文可以忽略。
比對數據庫為中國學術期刊網上出版數據庫、中國博士學位論文全文數據庫、中國優秀碩士學位論文全文數據庫、全國重要會議論文全文數據庫、中國重要報刊全文數據庫、中國專利全文數據庫、個人比對數據庫及其他比對數據庫。部分圖書不在知網圖書館，無法檢測。
論文上傳後，系統會自動檢測論文的章節信息。有些同學反映在段落中明明引用或抄襲了其他文獻的段落或句子，為什麽沒有檢測出來，這很正常。中國知網對這個檢測系統的靈敏度設置了壹個閾值，閾值為5%。段落方面，抄襲或者5%以下的引用是檢測不到的。