1，大廳
大雄寶殿，俗稱碩妃殿，內有壹塊供奉碩妃的牌位，每年由禮部按時祭祀。另外，這裏常年封閉，不允許任何人進入。正殿位於北區的中心。底部設置大夯土基礎，剩余高度約5.2米。周邊由寬度約為1.2m的基槽環繞..廟裏發現了兩排六根大石柱。
2.玻璃寶塔
琉璃塔位於正殿後面，始建於永樂十年(1412)，完成於宣德三年(1428)。它有九層八面，高78.2米。甚至在幾十裏外的長江上都能看到。塔上白瓷貼面，拱門上琉璃門票。底層有回廊(即宋代的“二次循環”)。
3.地下宮殿
地宮為圓形豎井式，由原山垂直開鑿而成。地宮內，從上到下有規律地填壹層石頭，夯壹層土，共39層。在距離地表4.2米處，地宮中央發現壹塊邊長約0.9米、厚約0.25米的方形覆蓋石。表土抽出後，其下露出壹方柱狀石字母。
大弘治的建築價值
作為中國古典建築文化的典範，南京大鴻鵠寺是我國考古發掘出的最大的寺廟遺址，為研究明代皇家寺廟的規制和布局提供了極其重要的資料。
建於北宋的昌贛寺地宮在塔基被發現，出土了以佛頂真骨為核心(碑文記載是由印度僧人帶到中國的)、以七寶阿育王塔為代表的大量珍貴佛教文物，在國內外引起巨大轟動。
這些重大發現對研究宋代佛塔地宮的建造、舍利存放制度、中西佛教的傳播與交流都具有重要意義。此次發掘還首次發現了在塔基周圍建造“鷹架”的線索，揭示了明代寶塔的建造方法，對我國古代建築技術史的研究具有重要價值。
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