西醫的基礎理論依賴於解剖學理論，將人體分為系統，包括呼吸系統、循環系統、運動系統、泌尿系統、神經系統、生殖系統、內分泌系統、消化系統。
中醫理論體系以陰陽五行學說為基礎，還涵蓋了藏象學說、經絡學說、氣血津液學說等。？
中醫與西醫的理論差異:對脈象的理解不同，主要取決於西醫脈象的搏動次數、規律性和強弱，而且除雙側橈動脈外，有時還根據不同的情況選擇腹動脈、頸動脈、足背動脈進行綜合診斷。
中醫更註重脈象的位置、速度、寬度和強度，中醫脈象更為復雜，包括生成脈、弦脈、沈脈、緩脈、結脈等28種脈象。
中西醫理論差異:對舌象的理解不同。除正常舌外，西醫其余舌像均以其形狀命名，如地圖舌(舌周增厚，呈白色或黃色)、牛舌(舌色似生牛肉，腫脹，對辛辣鹹味特別敏感)、草莓舌(舌尖紅點蔓延至舌兩側，整個舌色似草莓)、鏡舌。
中醫的舌象不僅取決於形狀，還取決於舌的顏色、厚薄、色澤、形狀、幹濕。
中西醫不同的診斷方法有問診、體格檢查、心電圖、實驗室檢查、醫學影像檢查等。
中醫的診斷方法主要靠聽、說、問。看是指看人的狀態，詢問病史，聽病人的聲音，聞病人的身體，摸病人的脈搏。
綜上所述，中醫和西醫有不同的理論體系，但沒必要去比較。這兩個都是用來治病的。只要能有效治療疾病，就是有用的藥。