為了合適的私生子，掌管太子府的事務。乾隆三十三年(1768)，授貴州都勻知府。赴任前，他以四級服留任，成了學士。同年，因坐盧建增鹽務案，被擢升至烏魯木齊協助軍務。被召回，授予編輯，回到學士辦公室，被任命為《四庫全書》主編。歷經13年慘淡經營，《四庫全書》完成，文章浩如煙海，共3460種，79339卷，分為經、史、書、集四大部分。嵇親自撰寫了《四庫全書總目提要》，有200卷，每壹卷都有提要、得失和細心的評價。同時，它也寫在紀曉嵐的《四庫全書提要》中
在精益求精的基礎上，作者編纂了《四庫全書簡明目錄》二十卷，是研究文史的重要工具書。《四庫全書》的編纂，無疑是對古籍收集整理、歷史文化遺產保存和發展的壹大貢獻。在主編《四庫全書》期間，紀曉嵐從侍從學士晉升為內閣學士，並壹度被任命為兵部侍郎。他沒有改變立場，仍然擔任內閣職務，很受皇帝歡迎。後來他被提升為左都時宇。《四庫全書》同年完成，被移至《禮記》中，作為宴請官員之用。乾隆皇帝特別厚道，讓他在故宮搭車。嘉慶八年(1803)，紀曉嵐迎來了八十大壽。皇帝發來賀電，並賜給他寶物。不久，承蒙合辦大學士，加太子少保爵位，兼國子監事務。六十歲後，五次赴都察院，三次任禮部尚書。紀曉嵐死後，他在翠兒村以南五英裏的村子裏建了壹座墳墓。朝廷派官員到北村山洞祭祀，嘉慶皇帝親自為他題詞，不勝榮幸，不勝悲痛。