在眾多的藏品中，出土的文物以巴蜀文物、四川漢代畫像磚、畫像、石陶俑、元末開國皇帝明於震淩銳的遺物等聞名。宋代傳世文物中，歷代名家書畫、名窯瓷器、明清紫砂、歷代錢幣、各代拓片、玉器、竹木牙器、絲綢、西南民族文物等都得到了系統的收藏。博物館收藏的近代文物也很豐富，很有特色，反映了近代以來四川和重慶的重要歷史進程，如太平天國、重慶宗教計劃、口岸和海關開放、川中同盟會、四川地下黨、抗戰首都、正面戰場等。該館還註重從四川各地選取民間手工藝的重要典型實物和代表性實物入藏，在展覽中生動再現各族人民的真實生活。
館藏文物約65438+萬件，數據5萬余條。具有重要歷史藝術價值的珍品有:四川舊石器500余件，巴蜀文物1000余件，漢畫像石、畫像磚1000余件，歷代名窯陶瓷4000余件，宋元以來書畫名家5000余件。博物館還收藏了明、張、秦良玉、鄒容等著名歷史人物的遺物，以及齊白石、張大千、徐悲鴻、等傑出畫家的作品。近現代文物約3萬件，包括太平天國、重慶宗教計劃、辛亥革命、五四運動、紅軍長征、抗日戰爭等重大歷史事件。此外，還有西南民族文物，包括羌族、藏族、彜族、苗族、土家族等民族的工藝品5000多件。