著名醫學雜誌《柳葉刀》發表的壹項關於青少年抑郁癥治療的研究指出，青少年抑郁癥患者應首先選擇心理治療。在無條件心理治療或心理治療無效的情況下，可以考慮藥物治療，但要強調個體化治療。
臨床醫務工作者在使用抗抑郁藥物的過程中，必須密切監測可能出現的副作用和潛在的自殺風險，尤其是在用藥初期。同時，壹些研究表明，大多數抗抑郁藥對青少年患者無效，壹些抗抑郁藥還可能有嚴重的副作用和潛在的自殺風險。在抗抑郁藥物方面，比較了抗抑郁藥物和安慰劑對青少年重性抑郁障礙的療效，發現氟西汀明顯優於安慰劑。
美國國家健康與護理卓越研究所(NICE)在2016年制定的青少年抑郁指南也指出，對於輕度抑郁的青少年，在初始治療中不使用抗抑郁藥物，對於輕度抑郁且無嚴重並發癥或自殺跡象的青少年，提供有限時間(2至3個月)的獨立非指示性支持治療、認知行為治療(CBT)或引導性自救。為中重度抑郁癥青少年提供針對性的心理治療(單獨CBT、人際關系治療、家庭治療或心理動力治療)；建議這種治療至少持續三個月。除非與心理治療結合，否則不要給青少年服用抗抑郁藥。藥物治療必須與心理治療相結合，除非患者拒絕心理治療。同時，應制定具體計劃，密切監測藥物不良反應，評估精神狀態和總體進展。
《中國抑郁障礙防治指南(第二版)》指出，青少年抑郁癥的治療應堅持抗抑郁藥和心理治療並重的原則。心理治療適用於不同嚴重程度的青少年抑郁癥患者，有助於改變認知，改善人格，增強應對困難和挫折的能力，最終改善抑郁癥狀，降低自殺率，減少功能損害。