消毒是為了防止感染，用物理和化學方法殺滅病原微生物，同時也殺滅大量非病原微生物。這是貫徹“預防為主，綜合防治”方針，贏得蠶繭和蠶種優質高產的重要措施。按性質分為化學消毒和物理消毒。按消毒範圍有蠶房、蠶具、蠶座、蠶體、蠶卵的消毒，按消毒時間有養蠶前消毒、養蠶中消毒、養蠶後消毒。
藥物的選擇和濃度是關鍵。壹般1%有效氯或0.5%次氯酸鈉能有效殺滅病毒。而1% ~ 2%的新鮮石灰漿也能很好的殺滅病毒。另外，2%福爾馬林石灰水、戊二醛石灰水、優氯網、消毒網效果都不錯。
註意病蠶、糞便和養蠶環境的處理。合理布局蠶房、桑葚貯藏室、上叢房、蠶沙池等。應該從大局考慮。重點放在主要方面，即從蠶病發病率和蠶的抗病、抗逆能力的角度，重點放在蠶房消毒上。
(2)嚴格分批提青，防止蠶座感染。
嚴格分批提青，淘汰弱蠶，是防止蠶窩感染的重要措施。壹般病蠶和感染病毒的蠶總是表現為晚睡、晚起、乏力，排出大量攜帶病毒的糞便，造成嚴重的蠶座感染。蠶座感染是蠶傳染性疾病暴發的重要原因。
蠶體和蠶座消毒是預防蠶座感染的有效方法。特別是三、四齡時，要加強施用石灰、防病1號、復合“蠶座網”對蠶體和蠶座進行消毒。這對消除養蠶傳染源，預防養蠶感染有很好的作用。
發現病蠶要及時治療。把病蠶撿起來扔進石灰盆裏。對於病批蠶沙，要堆在合適的地方漚制。
(3)加強飼養管理，增強蠶體質。
養好小蠶，收獲壹半。小蠶的抗病能力弱，吃了少量病原體就會發病，通過蠶座感染傳播。因此，做好小蠶的防病工作是關鍵。
註意消除誘發因素。比如孵化期和蠶期要防止高低溫的影響，蠶期要避免長時間的高溫悶熱環境。根據蠶的生理要求和飼養條件，改善飼養環境。比如“小蠶養在火裏，大蠶養在風裏”，重點在於良好的桑葚飽腹感，防止高溫悶熱天氣。
做好促青工作，努力將促青控制在適宜的溫度和濕度條件下，避免接觸30℃以上的高溫。
(4)選擇抗病性強的蠶品種。
培育抗病力強的蠶品種，如秋豐×白宇，是目前生產中抗病力強的蠶品種。