據《史記》記載，在古代，名醫於之擅長運用外科解剖學來治療疾病。他能夠切開皮膚並去除肌肉，打開胸膜，抓住網膜並清洗胃的五個內臟。如果說這個傳說過於離奇，難以令人信服，那麽中醫經典著作《黃帝內經》對人體內臟的詳細論述，則令人信服地說明，解剖活動在中醫中很早就開始了。《棺材》壹文說:人體的外部形狀可以通過測量得知，內部器官的位置和形狀的變化也可以通過觸診感知。死後可以解剖觀察每個人內臟的大小，內臟結構的堅固和脆弱程度，血管的長度，動脈和靜脈的血液顏色的變化。棺材還詳細描述了內臟的大小和長度。《黃帝內經》記載食管長度與大腸長度的比值為1.6: 56 = 1: 36，而現代醫學研究的比值為25: 925 = 1: 37。可見中國古代對大腸和食道長度的測量已經達到了相當精確的水平。
此後西漢、南北朝、隋唐時期都有解剖活動的記載。到了宋代，人體解剖學有了更大的發展，不僅積累了更多的解剖經驗，而且開始根據實物繪制圖譜，出現了專門的解剖圖。其中《歐熙範五藏圖》是(1041-1048)清代吳簡對宋代處死的歐熙範屍體進行解剖後所繪。書中描述了五臟的生理位置:心、肝、膽、脾在肺之下，小腸在胃之下，大腸在小腸之下，小腸清潔幹凈，大腸含穢，膀胱在大腸旁邊。這個描述和正常人的五臟位置基本壹致。宋崇寧年間(1102-1106)，楊潔的《存真》比《歐熙範五臟》更為準確，對人體的五臟六腑，如胸腔、腹腔、消化系統、泌尿系統、生殖系統等進行了詳細的描述，糾正了前人的許多說法。這本書對後世影響很大，很多醫家都用它來校正醫書。
《清代醫林糾謬》是中國解剖學的裏程碑。這是著名醫學家王清任在對屍體進行了40多年的直接觀察後寫的。此書共有25幅生理解剖圖，糾正了以往“肺有二十四孔”、“脾聞音動”、“尿從糞中滲出”等錯誤結論。他發現氣管有兩個分支和幾個細支氣管，同時他還發現了以前從未提及的重要器官，如頸動脈(書上稱之為“左右瓣”)、降主動脈(書上稱之為“保衛管”)以及幽門括約肌、膽總管、胰腺和十二指腸入口。尤其是對振膜的描述相當準確，說它“薄如紙，最堅固”。而且，通過自己的觀察，王清任再次肯定了大腦支配著思維和記憶的功能，說“腦波不在心中，而在腦中”。
歷代中醫對人體解剖的細致研究，極大地豐富了中醫的內容。但由於“身有皮肉之損，父母不可損”的封建禮教的嚴厲約束，中國的解剖實踐壹直都是由醫生秘密進行的，甚至在當時因為缺乏政府的支持而冒了很大的風險。正是因為這個原因，中國的解剖學壹直沒有走上獨立發展的道路，發展極其緩慢，最終被後來的西醫超越。這是中國醫學發展史上非常令人遺憾的事情。