復旦大學基礎醫學實驗教學中心堅持以人為本，加強實踐教學，開設自主創新的實驗課程，使學生獲得全面、系統、原創的知識體系和理念，培養創新型醫學精英。
該中心涵蓋形態學、功能主義、細胞與分子生物學、病原生物學四個基礎學科的實驗教學平臺，為八年制、五年制、六年制臨床醫學英語授課的留學生，基礎醫學、法醫學、預防醫學、公共衛生管理、藥學、護理等專業的本科生，以及所有醫學科學和部分其他專業(如生命科學)的研究生提供開展醫學實驗和實踐的學習平臺。
中心教學實驗室占地4600平方米，擁有亞洲標本最齊全的病理標本館和人體科學館。儀器設備價值約2400萬元，可容納600名學生同時進行實驗，開設83門實驗課，年工時近22萬人，每年參加實驗的學生達到1700余人。該中心是醫學生“實驗-實習-實踐”，培養科研素質、人文情懷和創新精神的開放式基地。五年來，學生在國內外雜誌上發表論文和總結100余篇，在校內外多次科技競賽和論壇上成績斐然。
基礎醫學實驗教學中心實行中心主任負責制，每個實驗教學平臺由4名副主任負責。該中心擁有壹支熱衷於教學和研究並具有學術背景的實驗教師隊伍。五年來獲得省市級以上教學成果獎8項，獲得省市級以上教學科研項目21項，發表教學研究論文50余篇，編審各類教材130余本，其中實驗教材36本，自制實驗教材及講義10本。近三年獲得省部級以上科研項目161項，總資助9724萬，發表1領域SCI論文53篇，獲得專利47項。中心擁有國家級教學團隊1人，上海市模範教師1人，上海市教學講師3人，上海市育才獎5人，寶鋼優秀教師獎18人，普康獎2人。
基礎醫學實驗教學中心堅持以學生為本的原則，以培養學生的實踐和創新能力為重要任務，貫穿現代醫學體系的教學理念，註重醫學專業的特殊性，將基礎醫學實驗教學與理論教學、科學研究和臨床實踐緊密結合。構建多層次覆蓋、多學科融合、多階段融合的立體化綜合實驗教學體系，打造“全導師制-課程體系改革-實踐創新論壇-科技創新中心”四位壹體的創新型醫學人才培養模式，建立四大實驗教學平臺，開展四個層次的實驗教學，促進學生知識、能力、思維、素質、能力的可持續發展。
根據教育部、上海市教委和學校的有關規定，中心不斷理順中心行政管理體制，完善人事管理制度，健全各項規章制度，完善質量保證體系，科學進行教學評估，鼓勵教學科研改革，合理使用運行經費，充分開放輻射，為人才培養、臨床服務和社會科學普及做出了應有的貢獻。
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