《史記》的版本大致分為四部。
主系統
為宋刻十行。
第二系統
大約有4種，是南宋紹興年間在杭州出版的十四行詩。南宋孝宗年間的建陽本；南宋朱在紹興十年出版《十二行》；南宋紹興年間，淮南東路轉運使刻九行。
三級系統
索音的註釋書有兩種，壹種是南宋惜春二年張謇刻本，另壹種是南宋惜春八年張謇刻本《庚丙》。
四元體系
現存最早的作品是南宋第七年蔡孟弼刻的兩個音符，後分為兩個分支。第壹種比較簡單:南宋慶元二年建陽《黃山賦》雜誌三註本、袁鵬銀翁刻本、明刻本、明柯偉雄刻本、明刻本、明刻本、清同治年間崇文書局刻本刻本、清同治年間金陵書局刻本張校本。第二個分支更復雜。這個分校是從蒙中二年版開始的。從中學版看，有明佑明版、明建陽神都齋版、明建寧官版、元大德版。而從大德本來說，又分為明南京國子監刻本和北京國子監刻本。清乾隆四年，武英殿刻本自北簡出版。
此外，還有另外壹個系列，即《明末雞骨閣史書十七》，這是壹個單立的詮釋，據說起源於宋代，但具體底數不詳。據此，清代同治年間再版的史書(金陵書局刻本)共有24部。