蘑菇菌絲由擔孢子萌發，擔孢子吸水膨脹後沿擔孢子長軸伸展，為絨毛狀單核菌絲，又稱初生菌絲，無形成子實體的能力；蘑菇菌種的生產主要是培養蓬松的單核菌絲。
當初生菌絲發育到壹定時間，並滿足適宜的環境條件時，結合發育成具有形成子實體能力的線狀次生菌絲；二級菌絲進壹步發展成線狀三級菌絲，具有分化各種組織的能力；無論哪壹級的菌絲體，都依賴於頂端細胞的反復分裂和伸長，同時不斷分枝。
許多菌絲相互交替，繁殖成繩狀菌絲體，在適宜的條件下，具有運輸營養物質和分化成子實體的能力。
蘑菇的子實體呈傘狀，單生，雙生或叢生。它是栽培者收獲的產物，子實體產生擔孢子，從而新壹代蘑菇的生長發育又開始了。