1、結束註釋
EndNote是SCI(湯姆森科學)的官方軟件。支持國際期刊的參考格式3776種，寫作模板上百種，涵蓋各個領域的雜誌，非常強大。End note問世較早，憑借其出色的文檔管理功能，End note可以說是市場上用戶數量最多的。
2、佐特羅
Zotero作為壹款開源軟件，相比End note最大的優勢就是免費，而且本身擴展性強，所以筆者認為Zotero比End note好用。與其他文檔管理軟件相比，Zotero更像是壹款知識管理軟件，不僅僅局限於文檔的管理，還可以實現知識的整合。
3、門德利
門德利是壹款免費的文檔管理軟件，也被稱為學術社交網絡平臺。它最初是由德國的三位醫生開發的，後來被愛思唯爾收購。要使用Men deley，您需要註冊壹個Elsevier帳戶。註冊後即可登錄官網。系統會推薦相同領域的相關文獻和研究人員，並且妳可以創建不同級別的群。
4、便簽快遞
Note Express(簡稱NE)是壹款國產文檔管理軟件，由北京愛琴海樂智科技有限公司開發，可用於文檔管理、寫作、提交等。它功能強大，易於使用。因為這個軟件是中國公司開發的，對中文文獻的支持遠遠強於Endnote、Mendeley等國外軟件。
5、讀取立方體
這個軟件是收費的，有30天免費試用版。它的網頁版體驗很好，和桌面版幾乎沒有區別，可以有壹個網站直接插入筆記本軟件。內置的閱讀器很好用，界面也很漂亮。