壹是明代有兩個都城，文物保存分散。
靖南之戰後，明朝開國者朱迪在建都北京的同時，保留了南京的機構設置，並將其作為首都。南京不僅有六大博物館，還有大量皇家文物。自宋代經濟重心南移以來，江南成為中國重要的文化中心，許多文化名人聚集於此。與廣大的北方地區相比，以南京、蘇州、杭州為代表的江南文化氛圍更濃，瓷業、手工業也更發達。這為南京保存大量明代文物奠定了基礎。
第二，明朝采用厚葬制度，文物都埋在地下。
明朝的十六位皇帝，包括明朝的開國皇帝朱迪，除了少數皇帝外，大部分都采用了重葬制。很多皇帝登基後就下令修建自己的皇陵。例如，明神宗定陵的修建持續了七年。定陵地宮在1956開放後，陪葬品不計其數，各種精美的瓷器、絲綢琳瑯滿目，堪稱壹座小型博物館。不幸的是，由於保存技術不完善和其他復雜的原因，定陵出土的許多文物都遭到了不可逆轉的破壞。
第三，明末國庫空虛，文物變賣。
到了明朝末年，由於連年戰亂，國庫空虛，很多大臣、將軍的基本俸祿都難以得到保障。崇禎皇帝為了保住自己的名山大川，不得不賣掉收藏在故宮的文物，所得款項用於彌補軍費的不足。所以到清朝入京的時候，很多文物要麽散落民間，要麽被破壞，大部分已經不存在了。
第四，李自成攻打北京後，文物損失慘重。
崇禎十七年(公元1644年)，李自成率領的起義軍入侵京城，與此同時，崇禎皇帝在景山自縊，明朝宣告滅亡。李自成進入紫禁城後，燒殺搶掠，放火焚燒。據《清史稿》記載，李自成當時下令？火燒宮殿，背上包袱往西走？。除了武英殿(李自成登基的地方)、建機殿、角樓等少數建築外，其他宮殿全部被毀，只剩下地基。火燒故宮可以說是對明文物的壹次劫掠，大量文物被劫掠破壞。
基於以上原因，故宮保存的明代建築和文物並不多，甚至比南京還少。很可惜，見證了明朝200多年興衰的故宮，曾經輝煌過，如今卻沒有留下多少明朝的痕跡。