在博物館裏,前翼的四層是辦公樓,後翼的七層是書庫。書庫采用夾層擴大使用面積,高度僅為2.4米,充分考慮空間利用的經濟性。書庫使用面積約為1186平方米,藏書容量最初為15萬-20萬冊,擴建後達到40萬冊,在民國時期的大學圖書館中為數不多。
老圖書館的藏書非常豐富,從難得壹見的《迎松方圓》刻本,到明清方誌叢書,從經史子集到家譜,從民國歷史文獻到武漢大學師生作品集...武漢大學現有網上古籍20多萬冊,其中善本800多冊(其中300多冊已被列入《中國古籍善本書目》),1000多冊。