乾隆四年(公元1739年)，乾隆皇帝下詔編纂醫書，任命吳倩、劉禹鐸為主編。作為主編，吳倩對《醫宗金鑒》的編纂做出了重要貢獻。吳倩認為，歷代醫典和各種醫書存在“用詞晦澀，傳不正，或博學而不精，或雜而異”的問題，應“加以糾正和註釋，以明辨是非”。
吳倩提倡仲景學說。他在撰寫《醫宗金鏡》時，參考了清乾隆以前學過《傷寒論》和《金匱要略》的20多位醫家的著作，對這兩部經典著作的原文進行了逐壹註釋，並編撰了修訂後的《仲景全書》？《傷寒論註》卷17，修訂版仲景全書？《金匱要略》共8卷，列為《醫宗金鏡》壹書之首。
《醫宗金鑒》是清代乾隆皇帝編纂的壹部大型綜合性醫學叢書。清初，社會經濟發展，國力達到頂峰，宮廷醫學也達到頂峰。乾隆皇帝欲標榜文明統治，於乾隆四年(1739)命太醫院編醫書:“妳衙門要編醫書，以正醫學。”在大學士鄂爾泰和洪州太子的監督下，任命禦醫吳倩、劉禹鐸為主編(相當於總編輯)，任命陳芷菁為圖書經理。為了保證醫學書籍的質量，選擇了知識淵博、精通醫學、精通文理的學者進行編纂，主編14，副主編12，吳等人作為編輯參與編纂。此外，還有審查員、轉錄員等人員，70余人參與了編纂工作。在編纂中，不僅選取了宮中收藏的醫書，還廣泛收集了歷代流傳下來的新舊醫書、家傳秘方、驗方等。
1742年，《宗彜金鑒》編纂完成。乾隆皇帝給它冠以宗彜金鑒的稱號，並給每位編輯壹本書和壹尊小小的針灸銅像作為獎品。從1749開始，清泰醫院指定醫學宗金鑒作為醫學生教材。這本書也在民間廣為流傳，深受讀者歡迎。
《醫宗金鑒》是作者對18世紀以前的歷代醫籍進行修改、刪減、編輯而成的壹部著作，是宮廷醫家集體智慧的結晶。《醫宗金鑒》壹書從醫學文獻校勘和整理的角度反映了宮廷醫學的學術水平和成就。