1994年,東莞博物館新館竣工對外開放。新館高五層,占地2700平方米,建築面積5800平方米,展覽面積3300平方米。壹樓是臨時展區,是藝術活動和流動展覽的場地。分為大堂展廳和後院展廳,有古鐘亭和古典亭。迄今為止,已經舉辦了300多個臨時展覽。二樓是專門的展區,定期展示館藏文物,介紹高品位的文物展覽。目前,已舉辦了許多高品位的專題展覽,如歷年來在景德鎮出土的明代官窯瓷器精品展、鄧白書畫展、居巢居廉書畫展、歷代東關書畫展、中國國寶——戰國貝嶺展、於海清輝常熟博物館藏明清書畫展等。三樓是“古東莞”基本陳列,再現東莞五千年文明和悠久歷史,是愛國主義教育和九年級的重要基地。現在全年免費向公眾開放(周壹閉館)。