1，與生姜、人參同用，可治厥陰頭痛、幹嘔涎沫、苔白脈遲等。
2.常與小茴香、川楝子、木香同用，治冷疝氣、腹痛；
3.可與桂枝、當歸、川芎配伍，用於治療虛寒血瘀所致的痛經。
4.與木瓜、紫蘇葉、檳榔等配伍。治療因寒濕引起的腳氣腫痛，或沖入腹部。
2散寒止痛。吳茱萸味苦導瀉，熱散寒，善散寒止痛，疏肝解郁，降逆止嘔，還能抑酸止痛。
1，常與幹姜、甘草同用，治霍亂腹痛嘔吐；
2.可與半夏、生姜同用，治療因外寒侵襲、胃失和墜而致的嘔吐；
3、與黃連配伍，可治肝郁火旺，肝胃不和之脅痛苦味，嘔吐吞酸。
3溫補脾腎吳茱萸辛熱，能溫補脾腎，助陽止瀉。是五更中治療脾腎陽虛泄瀉的常用藥。常與補骨脂、肉豆蔻、五味子等等同用，如申思丸(女學筆記良方)。
抗菌吳茱萸的醇提取物對蛔蟲有明顯作用，其水煎液對霍亂弧菌有很強的抑制作用。吳茱萸水提取物對絮狀表皮癬菌、奧杜邦小孢子菌等11種皮膚真菌也有不同程度的作用。