就像蒙古攻打南宋壹樣，南方麗江的首領為了躲避戰亂，把統治中心遷到了獅子山。當時麗江的領導是木石，麗江古城有個地方叫？木府？景點是穆的住所。因為政治中心的轉移，他們需要在獅子山周圍重建房屋和城市。這座城市就是今天的麗江古城。蒙古攻下南宋後繼續南下，忽必烈在蒙古可汗的指揮下率軍攻打大理。當聽到忽必烈到達雲南的消息時，麗江的穆氏擔心他會出兵麗江，於是主動迎接投降。
麗江投降後，忽必烈繼續向大理進發。大理的實力自然不如蒙古，所以進攻後不久就棄兵投降了。從此雲貴高原並入蒙古。蒙古汗死後，蒙古因為內部矛盾而分裂，其中忽必烈占領了壹部分，建立了元朝。元朝建立後，忽必烈率軍剿滅南宋流亡政權，並由此成為中原第壹個少數民族政權。原來屬於蒙古的麗江，從此成為元朝版圖的壹部分。
在隨後的發展中，麗江古城的房子越來越多。到明朝末年，那裏已經有上千戶人家了。雍正年間，麗江迎來了第壹位正式知府。知府到任後，修建了衙門、營房等場所，並在這些場所周圍修建了城墻，麗江古城規模進壹步擴大。如今，麗江古城已經成為麗江的壹個代表性景點，每年都有許多遊客前往參觀。