陰陽理論作為壹種生理、病理、診斷模型進行研究:陰陽對立統壹模型在中醫臟腑、生理、病理、診斷、治療、預後等方面有明確的應用。“人生有形，莫先陰陽。”“好診斷，查色把脈，先別陰陽。”過去，陰陽對立、相互依存、相互轉化的規律很容易被認為只是壹種思辨的理論。陰陽模型的現代研究主要是基於cAMP/cGAP來研究其物質基礎。1973年，國外學者Goldbeig首次提出人類信息傳遞的第二信使系統cAMP/cGAP這兩個環核苷酸之間存在類似的關系，cAMP為陽性，cGAP為陰性。上海內分泌所匡安坤在《中華內科雜誌》1978發表了《陽虛患者內分泌、免疫及環核苷酸變化的初步觀察》。在研究了20多種疾病後，這壹理論得到了證實，從而導致了對陰陽學說關系模型的再次確認。65438-0979上海第二醫學院夏宗勤在《中醫雜誌》發表文章《中醫虛證理論初探(陰虛與陽虛患者血漿環核苷酸含量變化的比較)》，指出陰虛時cAMP含量明顯升高，cAMP/cGAP比值無明顯下降。而陽虛患者cGAP含量明顯升高，cAMP/cGAP比值明顯下降。1980，陳奇在《江西中醫雜誌》發表《cAMP、cGAP與中醫陰陽學說》壹文。隨後對陰陽兩虛證、氣血兩虛證、寒熱證等各證型的cAMP/cGAP變化進行了相關研究。對陰虛、陽虛患者做了大量工作，說明陰虛時主要是cAMP升高；陽虛時，cAMP/cGAP比值下降。
作為具有特定生理、病理和診斷意義的陰陽學說的研究，壹般稱為陰氣和陽氣的研究。在這方面，整體的陰陽和具體的臟腑是有區別的。後者可見於證候的研究。兩者的本質是壹樣的。從具體研究內容來看，整體陰陽與具體臟腑的區別，往往只是見仁見智。此外，寒熱的研究也與陰陽學說的研究密切相關，可以借鑒。
五行學說是古代漢人樸素的辯證唯物主義哲學。中醫基礎理論是應用古代哲學理論中的木、火、土、金、水五大特征，對自然界的系統結構和方法論進行認識和解釋，以此來解釋人體臟腑之間的關系、臟腑器官的屬性、運動變化以及人體與外界環境的關系，從而建立起來的。“五行”與“五臟”和“五誌”有著密切的關系。當五行不能維持互生互制的生理平衡時，生與制的關系就轉化為乘(乘虛而入，過制)與欺(被欺強欺主)的關系，產生相應的相關病理變化。將“五行學說”應用於心身疾病的治療，通過調節情緒，巧妙用藥，可以促進心身疾病的康復。
對五行學說的研究主要集中在其方法論意義上，但作為壹種生理、病理、診療模式和具體的生理、病理、診療意義，對五行學說的研究較少。它的發展過程與陰陽學說是同步的。五六十年代對五行學說的研究主要集中在闡述其哲學意義上，但已有論文從控制論的角度論述五行學說，如當時的《中醫——世界科學史上的奇跡》壹文，在80年代影響很大。在“文革”後的中醫多學科研究中，控制論原理和五行學說的研究是這壹熱潮的基礎和重點。65438-0978，劉冠軍在《浙江中醫學院學報》發表《從控制論看中醫五行學說》。這項研究的成果之壹是，在中醫計算機診療系統上出現了大量的研究。並形成了宋瑞玉《受控中醫》等系統著作。20世紀90年代，吉林省中醫研究院王慶文運用計算機控制論原理，探索五行學說的科學內涵及其在辨證論治中的應用。