明清時期，封建經濟在黎族社會占主導地位，大部分黎族地區的生產力與當地漢族相近。相鄰的漢族地區出現了許多著名的市場，如刁南城、楊瀾城、南豐城和淩門店。山區黎族的土特產通過集市和在山區收購的漢族商人流向著名的地方，黎族交換的鐵器生產工具和生活資料也日益增多。黎族和漢族人民之間的經濟聯系、文化交流和通婚，促進了民族之間的融合。在雅周的壹些發達地區，當地的黎族人已經經常“往來於城市之間，無論他們之間是否容易交流，有時他們是有文化的。”至於開發較早的文昌、澄邁、會同(今瓊海市)等地，到清代中期，黎族已基本融入漢族，有些地方出現了“無黎”之說(如“文昌無黎”)。還有壹些漢人，“因近黎土，熟黎風俗”，“益其山水田，造村，耕田”，逐漸同化為黎族人。
明朝中後期，苗族作為軍隊從廣西進入海南島。據《雅周誌》“又有壹種苗栗，數以百計。.....蓋明清，剿羅火，抱二洞，築營寨，調廣西苗兵防守，稱瑤弓手。棄營後，兒孫散於谷中，仍名苗。”以上史實表明，苗族士兵是被強征到海南島定居的。除了來海南當兵的，還有相當壹部分苗族人，不堪階級壓迫和民族壓迫，漂洋過海來到海南島謀生。