經過壹段時間的倉促發掘，他們發現泥人如此之多，場面之宏大超乎他們的想象。他們怕整體出土，容易被烈日暴曬風化，被雨水瓦解，於是停止挖掘，建造整體結構，技術上有問題。壹旦發掘出來，陵墓中的許多文物暴露在空氣中會迅速氧化。當時的文物管理和保護技術還不足以支撐秦陵的繼續發掘和開發。
文物直接暴露在空氣中，暴露在風吹日曬下，下雨時只能臨時用塑料布或草席覆蓋。建築的立體結構和施工方法與壹號坑相同。在試掘過程中，出土了224件陶俑、11輛戰車、96匹陶馬和許多重要武器，並發現了大量珍貴文物。這種情況不利於文物保護。
同時，由於技術問題，在秦兵馬俑的研制過程中，由於當時技術能力太差，兵馬俑被損壞，更重要的是壹股氣體壓死人，於是上報有關部門立即停止。現在需要不斷回填。壹號坑的後部是修復區，所有挖掘出來的兵馬俑都放在最後壹塊地上進行修復。由於破壞嚴重，以及對出土文物保護的低估，兵馬俑受到了不可修復的破壞。壹些赤土俑會因為突然接觸空氣而改變顏色。為了更好地保護文物，兵馬俑的發掘被叫停。
但由於在地下埋藏了2000多年，挖掘出來後接觸到氧氣就會氧化，漆層會氧化剝落。可能是這個原因，當年的發掘工作被緊急叫停。