彭玉麟與曾國荃的惡劣關系始於曾國荃攻占安慶之後。1861九月，曾國荃率領湘軍攻克安慶後，展開了大規模的屠殺。城裏所有的人，男女老幼，都被殺了，所有的屍體都被丟棄到長江裏。彭玉麟得知曾國荃大屠殺後非常憤慨，給曾國藩寫了壹封信，要求他以家庭為重，殺死曾國荃。
1864年曾國荃攻陷江寧後，彭玉麟與曾國荃的矛盾進壹步激化。像征服安慶之後壹樣，這壹次曾國荃率領他的軍隊屠殺平民，燒殺搶掠。彭玉麟得知後，再次致信曾國藩，要求他殺死曾國荃。
後來，又發生了所謂的劉守田事件，導致了彭玉麟與曾國荃矛盾的全面爆發。劉守田原是曾氏兄弟手下的秦冰，後被曾國荃派往彭玉麟軍營監視彭玉麟的行動。
這個劉守田自以為是曾氏兄弟的密友，在彭玉麟陣營可以為所欲為。他到處散布關於彭玉麟的壞消息，包括彭玉麟兩次請求曾國藩殺死曾國荃。劉守田此舉對項水師產生了極壞的影響。
彭玉麟得知此事後，把劉守田綁起來，開除他，割下他的耳朵，並命令他不得回江寧找曾國藩和曾國荃。接著，彭玉麟第三次致信曾國藩，要求他懲罰胡作非為的曾國荃。曾國藩得知劉守田被處理後，大怒，並收到彭玉麟的壹封信，請求批準殺死曾國荃。他不敢相信，自己親自訓練的彭玉麟竟然敢把鬥爭的矛頭指向自己的親哥哥。他立即給彭玉麟寫了壹封信。在信中，他問彭玉麟為什麽未經他的允許就把劉守田撤職，並割下他的耳朵。他還問他為什麽對曾國荃如此敵視，並壹次又壹次地想殺死他。曾國藩最後說，他帶了十幾年兵，曾國荃的吉字營有什麽弊端，妳不知道嗎？
得到曾國藩的答復後，彭玉麟知道如果事情再擴大，可能會導致他與曾國藩決裂，於是不再對此事發表意見。
從彭玉麟三次邀請懲罰曾國荃，我們可以看到彭玉麟是多麽直爽。盡管曾國藩對他很好，但這絲毫不影響他對曾國荃的判斷。在彭玉麟眼裏，只有正義和公理，沒有所謂的私情。