1.整體概念:《內經》中關於肝主筋脈，腎主骨生髓，腦為髓海，髓海空虛，腦失養，血養經絡骨的論述是臨床的理論基礎。肢體從外部損傷導致從內部氣血不足，也就是說人體的損傷必然會影響整體，所以整體治療才能得到好的效果。
2.通經絡:活血化瘀是治療腦萎縮(腦萎縮、小腦萎縮)合並肌肉萎縮的原則。治療方法必須以活血化瘀為先，瘀血不散。瘀血不散，經絡不通，大腦和肌肉就會失去營養。
3.註意外邪入侵:此病為外邪入侵，精血津液運行受阻，導致肌肉、神經受損。只有排除外邪，才能保證津液不枯竭，腦萎縮(腦萎縮和小腦萎縮)合並肌肉萎縮才能恢復。
4.強調身體的虛弱:重點強調心、肝、腎、脾、胃的虛弱是腦萎縮(腦萎縮、小腦萎縮)中晚期肌萎縮的主要發病機制。身體越虛弱，病情越嚴重，身體越衰弱，形成惡性循環。所以要以早期治療為主，這是抵抗這種疾病的基礎。