桓伊有軍事才能，多次參與州府軍務，遷居傅參軍。後來被任命為淮南太守。因軍隊禦敵有方，升任豫州十二郡都督、揚州江西五郡軍令、建威將軍、溧陽知府。太和六年(371)，擊敗前秦王建、章昊，以戰功獲得宣城郡稱號，升任豫州都督、西部中郎將、豫州刺史。建元十九年(383)，謝衍、苻堅敗於淝水，封永修郡侯、右軍將軍。
太原九年(384)，被朝廷任命為江州、荊州十郡、豫州四郡的軍事統帥，兼江州刺史。服役多年後，他被召回北京，他成了壹名保護軍隊的將軍。他在任期內去世。朝廷追授了右將軍，並加了壹個散騎為他效力。謚號是英雄。
桓伊擅長吹笛子，被譽為“笛聖”。鋼琴曲《梅花三弄》就是根據他的笛子譜子改編的。桓伊唱挽歌，唱音樂歌，袁唱《難去》，當時被人們稱為“三絕”。[2]
《晉書》點評:①伊有武功，明簡率為標準。②伊人謙虛，雖有大成就，但從不為。好音樂，壹時之妙，江左第壹。
唐·杜牧《潤州二首》詩:壹般來說，南朝心胸寬廣，東晉最風流。月明多想浣衣，壹笛聞壹吹“堤”之悲。[24]
胡《遊逸山閱臺詩》詩:晉朝是衣冠夢，青天是閱堂。浣衣曾吹古汀笛，萬香吹梅花。
《晉書》卷81傳51